Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LtbP41155 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LtbP41155 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LtbP41155 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LtbP41155 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LtbP41155 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LtbP41155 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LtbP41155 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LtbP41155 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LtbP41155 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LtbP41155 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LtbP41155 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LtbP41155 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LtbP41155 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LtbP41155 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LtbP41155 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LtbP41155 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LtbP41155 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LtbP41155 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LtbP41155 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LtbP41155 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LtbP41155 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LtbP41155 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LtbP41155 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LtbP41155 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LtbP41155 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LtbP41155 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LtbP41155 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LtbP41155 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LtbP41155 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LtbP41155 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LtbP41155 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LtbP41155 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LtbP41155 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LtbP41155 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LtbP41155 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LtbP41155 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LtbP41155 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LtbP41155 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LtbP41155 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LtbP41155 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LtbP41155 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LtbP41155 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LtbP41155 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LtbP41155 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LtbP41155 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LtbP41155 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LtbP41155 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LtbP41155 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LtbP41155 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LtbP41155 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LtbP41155 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LtbP41155 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LtbP41155 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LtbP41155 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LtbP41155 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LtbP41155 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LtbP41155 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LtbP41155 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LtbP41155 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LtbP41155 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LtbP41155 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LtbP41155 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LtbP41155 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LtbP41155 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LtbP41155 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LtbP41155 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LtbP41155 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LtbP41155 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LtbP41155 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LtbP41155 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LtbP41155 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LtbP41155 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LtbP41155 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LtbP41155 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LtbP41155 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LtbP41155 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LtbP41155 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LtbP41155 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LtbP41155 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LtbP41155 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LtbP41155 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LtbP41155 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LtbP41155 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LtbP41155 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LtbP41155 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LtbP41155 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LtbP41155 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LtbP41155 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LtbP41155 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LtbP41155 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LtbP41155 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LtbP41155 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LtbP41155 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LtbP41155 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LtbP41155 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LtbP41155 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LtbP41155 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LtbP41155 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LtbP41155 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms