Protein–RNA interactions for Protein: P40124

Cap1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cap1P40124 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cap1P40124 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cap1P40124 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cap1P40124 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cap1P40124 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Cap1P40124 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cap1P40124 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cap1P40124 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cap1P40124 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cap1P40124 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cap1P40124 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cap1P40124 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Cap1P40124 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Cap1P40124 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cap1P40124 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cap1P40124 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cap1P40124 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cap1P40124 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cap1P40124 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cap1P40124 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cap1P40124 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cap1P40124 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cap1P40124 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cap1P40124 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cap1P40124 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cap1P40124 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cap1P40124 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cap1P40124 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cap1P40124 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cap1P40124 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cap1P40124 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cap1P40124 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cap1P40124 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cap1P40124 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cap1P40124 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cap1P40124 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cap1P40124 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cap1P40124 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Cap1P40124 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Cap1P40124 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cap1P40124 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cap1P40124 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Cap1P40124 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cap1P40124 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Cap1P40124 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cap1P40124 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cap1P40124 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cap1P40124 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cap1P40124 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cap1P40124 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cap1P40124 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cap1P40124 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cap1P40124 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cap1P40124 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cap1P40124 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cap1P40124 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cap1P40124 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cap1P40124 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Cap1P40124 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cap1P40124 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cap1P40124 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cap1P40124 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cap1P40124 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cap1P40124 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cap1P40124 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cap1P40124 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cap1P40124 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cap1P40124 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cap1P40124 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cap1P40124 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cap1P40124 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cap1P40124 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cap1P40124 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cap1P40124 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cap1P40124 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cap1P40124 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cap1P40124 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cap1P40124 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cap1P40124 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cap1P40124 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cap1P40124 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cap1P40124 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cap1P40124 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cap1P40124 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cap1P40124 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cap1P40124 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cap1P40124 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cap1P40124 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Cap1P40124 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cap1P40124 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cap1P40124 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cap1P40124 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cap1P40124 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Cap1P40124 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cap1P40124 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cap1P40124 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cap1P40124 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Cap1P40124 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cap1P40124 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cap1P40124 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms