Protein–RNA interactions for Protein: P39876

Timp3, Metalloproteinase inhibitor 3, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp3P39876 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Timp3P39876 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Timp3P39876 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Timp3P39876 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Timp3P39876 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Timp3P39876 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Timp3P39876 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Timp3P39876 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Timp3P39876 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Timp3P39876 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Timp3P39876 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Timp3P39876 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Timp3P39876 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Timp3P39876 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Timp3P39876 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Timp3P39876 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Timp3P39876 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Timp3P39876 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Timp3P39876 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Timp3P39876 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Timp3P39876 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Timp3P39876 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Timp3P39876 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Timp3P39876 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Timp3P39876 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Timp3P39876 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Timp3P39876 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Timp3P39876 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Timp3P39876 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Timp3P39876 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Timp3P39876 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Timp3P39876 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Timp3P39876 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Timp3P39876 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Timp3P39876 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Timp3P39876 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Timp3P39876 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Timp3P39876 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Timp3P39876 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Timp3P39876 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Timp3P39876 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Timp3P39876 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Timp3P39876 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Timp3P39876 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Timp3P39876 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Timp3P39876 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Timp3P39876 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Timp3P39876 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Timp3P39876 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Timp3P39876 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Timp3P39876 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Timp3P39876 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Timp3P39876 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Timp3P39876 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Timp3P39876 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Timp3P39876 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Timp3P39876 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Timp3P39876 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Timp3P39876 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Timp3P39876 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Timp3P39876 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Timp3P39876 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Timp3P39876 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Timp3P39876 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Timp3P39876 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Timp3P39876 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Timp3P39876 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Timp3P39876 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Timp3P39876 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Timp3P39876 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Timp3P39876 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Timp3P39876 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Timp3P39876 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Timp3P39876 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Timp3P39876 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Timp3P39876 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Timp3P39876 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Timp3P39876 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Timp3P39876 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Timp3P39876 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Timp3P39876 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Timp3P39876 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Timp3P39876 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Timp3P39876 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Timp3P39876 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Timp3P39876 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Timp3P39876 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Timp3P39876 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Timp3P39876 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Timp3P39876 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Timp3P39876 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Timp3P39876 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Timp3P39876 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Timp3P39876 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Timp3P39876 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Timp3P39876 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Timp3P39876 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Timp3P39876 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Timp3P39876 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Timp3P39876 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms