Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rfc1P35601 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rfc1P35601 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rfc1P35601 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rfc1P35601 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rfc1P35601 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rfc1P35601 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rfc1P35601 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rfc1P35601 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rfc1P35601 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rfc1P35601 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rfc1P35601 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rfc1P35601 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rfc1P35601 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rfc1P35601 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rfc1P35601 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rfc1P35601 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfc1P35601 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfc1P35601 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfc1P35601 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfc1P35601 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rfc1P35601 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rfc1P35601 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rfc1P35601 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rfc1P35601 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rfc1P35601 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rfc1P35601 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rfc1P35601 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rfc1P35601 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rfc1P35601 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rfc1P35601 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rfc1P35601 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rfc1P35601 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rfc1P35601 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rfc1P35601 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rfc1P35601 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rfc1P35601 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rfc1P35601 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rfc1P35601 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rfc1P35601 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rfc1P35601 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rfc1P35601 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rfc1P35601 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rfc1P35601 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rfc1P35601 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rfc1P35601 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfc1P35601 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfc1P35601 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfc1P35601 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfc1P35601 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfc1P35601 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfc1P35601 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfc1P35601 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfc1P35601 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfc1P35601 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfc1P35601 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfc1P35601 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfc1P35601 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfc1P35601 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfc1P35601 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rfc1P35601 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rfc1P35601 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rfc1P35601 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rfc1P35601 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rfc1P35601 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rfc1P35601 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rfc1P35601 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rfc1P35601 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rfc1P35601 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rfc1P35601 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rfc1P35601 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rfc1P35601 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rfc1P35601 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rfc1P35601 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rfc1P35601 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rfc1P35601 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rfc1P35601 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rfc1P35601 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rfc1P35601 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rfc1P35601 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rfc1P35601 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rfc1P35601 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rfc1P35601 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rfc1P35601 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rfc1P35601 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rfc1P35601 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rfc1P35601 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rfc1P35601 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rfc1P35601 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rfc1P35601 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rfc1P35601 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rfc1P35601 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rfc1P35601 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rfc1P35601 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rfc1P35601 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rfc1P35601 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rfc1P35601 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rfc1P35601 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rfc1P35601 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rfc1P35601 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms