Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gjb3P28231 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gjb3P28231 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gjb3P28231 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gjb3P28231 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gjb3P28231 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gjb3P28231 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gjb3P28231 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gjb3P28231 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gjb3P28231 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gjb3P28231 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gjb3P28231 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gjb3P28231 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gjb3P28231 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gjb3P28231 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gjb3P28231 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gjb3P28231 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gjb3P28231 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gjb3P28231 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gjb3P28231 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gjb3P28231 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gjb3P28231 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gjb3P28231 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gjb3P28231 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gjb3P28231 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gjb3P28231 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gjb3P28231 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gjb3P28231 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gjb3P28231 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gjb3P28231 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gjb3P28231 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gjb3P28231 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gjb3P28231 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gjb3P28231 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gjb3P28231 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gjb3P28231 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gjb3P28231 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gjb3P28231 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gjb3P28231 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gjb3P28231 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gjb3P28231 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gjb3P28231 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gjb3P28231 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gjb3P28231 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gjb3P28231 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gjb3P28231 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gjb3P28231 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gjb3P28231 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gjb3P28231 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gjb3P28231 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gjb3P28231 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gjb3P28231 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gjb3P28231 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gjb3P28231 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gjb3P28231 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gjb3P28231 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gjb3P28231 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gjb3P28231 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gjb3P28231 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gjb3P28231 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gjb3P28231 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gjb3P28231 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gjb3P28231 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gjb3P28231 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gjb3P28231 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gjb3P28231 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gjb3P28231 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gjb3P28231 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gjb3P28231 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gjb3P28231 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gjb3P28231 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gjb3P28231 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gjb3P28231 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gjb3P28231 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gjb3P28231 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gjb3P28231 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gjb3P28231 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gjb3P28231 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gjb3P28231 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gjb3P28231 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gjb3P28231 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gjb3P28231 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gjb3P28231 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gjb3P28231 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gjb3P28231 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gjb3P28231 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gjb3P28231 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gjb3P28231 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gjb3P28231 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gjb3P28231 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gjb3P28231 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gjb3P28231 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gjb3P28231 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gjb3P28231 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gjb3P28231 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gjb3P28231 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gjb3P28231 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gjb3P28231 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gjb3P28231 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gjb3P28231 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms