Protein–RNA interactions for Protein: P27782

Lef1, Lymphoid enhancer-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lef1P27782 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lef1P27782 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lef1P27782 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lef1P27782 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lef1P27782 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lef1P27782 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lef1P27782 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lef1P27782 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lef1P27782 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lef1P27782 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lef1P27782 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lef1P27782 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lef1P27782 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lef1P27782 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lef1P27782 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lef1P27782 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lef1P27782 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lef1P27782 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Lef1P27782 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lef1P27782 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Lef1P27782 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lef1P27782 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lef1P27782 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lef1P27782 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lef1P27782 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lef1P27782 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lef1P27782 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lef1P27782 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lef1P27782 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Lef1P27782 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lef1P27782 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lef1P27782 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Lef1P27782 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lef1P27782 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lef1P27782 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lef1P27782 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lef1P27782 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lef1P27782 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lef1P27782 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lef1P27782 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lef1P27782 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lef1P27782 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Lef1P27782 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lef1P27782 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lef1P27782 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lef1P27782 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lef1P27782 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lef1P27782 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lef1P27782 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lef1P27782 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Lef1P27782 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lef1P27782 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lef1P27782 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lef1P27782 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lef1P27782 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lef1P27782 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lef1P27782 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Lef1P27782 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Lef1P27782 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Lef1P27782 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Lef1P27782 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lef1P27782 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lef1P27782 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Lef1P27782 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lef1P27782 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lef1P27782 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lef1P27782 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Lef1P27782 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lef1P27782 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lef1P27782 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Lef1P27782 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lef1P27782 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lef1P27782 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lef1P27782 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lef1P27782 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lef1P27782 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lef1P27782 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lef1P27782 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lef1P27782 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lef1P27782 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lef1P27782 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lef1P27782 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lef1P27782 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lef1P27782 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lef1P27782 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lef1P27782 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lef1P27782 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lef1P27782 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lef1P27782 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lef1P27782 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lef1P27782 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lef1P27782 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lef1P27782 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lef1P27782 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lef1P27782 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lef1P27782 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lef1P27782 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lef1P27782 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lef1P27782 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lef1P27782 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms