Protein–RNA interactions for Protein: P23611

Irf8, Interferon regulatory factor 8, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf8P23611 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Irf8P23611 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Irf8P23611 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Irf8P23611 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Irf8P23611 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Irf8P23611 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Irf8P23611 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Irf8P23611 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Irf8P23611 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Irf8P23611 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Irf8P23611 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Irf8P23611 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Irf8P23611 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Irf8P23611 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Irf8P23611 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Irf8P23611 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Irf8P23611 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Irf8P23611 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Irf8P23611 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Irf8P23611 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Irf8P23611 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Irf8P23611 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Irf8P23611 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Irf8P23611 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Irf8P23611 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Irf8P23611 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Irf8P23611 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Irf8P23611 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Irf8P23611 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Irf8P23611 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Irf8P23611 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irf8P23611 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Irf8P23611 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Irf8P23611 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irf8P23611 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irf8P23611 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irf8P23611 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irf8P23611 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irf8P23611 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irf8P23611 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Irf8P23611 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Irf8P23611 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irf8P23611 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irf8P23611 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irf8P23611 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irf8P23611 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irf8P23611 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irf8P23611 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Irf8P23611 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Irf8P23611 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Irf8P23611 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Irf8P23611 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Irf8P23611 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Irf8P23611 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Irf8P23611 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Irf8P23611 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irf8P23611 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irf8P23611 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irf8P23611 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irf8P23611 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irf8P23611 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irf8P23611 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Irf8P23611 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irf8P23611 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irf8P23611 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irf8P23611 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irf8P23611 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irf8P23611 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Irf8P23611 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Irf8P23611 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Irf8P23611 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Irf8P23611 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Irf8P23611 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Irf8P23611 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irf8P23611 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irf8P23611 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irf8P23611 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irf8P23611 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irf8P23611 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irf8P23611 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irf8P23611 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Irf8P23611 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Irf8P23611 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Irf8P23611 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irf8P23611 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irf8P23611 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irf8P23611 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Irf8P23611 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Irf8P23611 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irf8P23611 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Irf8P23611 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irf8P23611 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Irf8P23611 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Irf8P23611 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Irf8P23611 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Irf8P23611 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Irf8P23611 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Irf8P23611 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Irf8P23611 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Irf8P23611 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms