Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tap1P21958 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tap1P21958 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tap1P21958 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tap1P21958 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tap1P21958 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tap1P21958 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tap1P21958 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tap1P21958 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tap1P21958 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tap1P21958 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tap1P21958 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tap1P21958 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tap1P21958 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tap1P21958 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tap1P21958 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tap1P21958 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tap1P21958 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tap1P21958 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Tap1P21958 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tap1P21958 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tap1P21958 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tap1P21958 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tap1P21958 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tap1P21958 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tap1P21958 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tap1P21958 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tap1P21958 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tap1P21958 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tap1P21958 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tap1P21958 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tap1P21958 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tap1P21958 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tap1P21958 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tap1P21958 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tap1P21958 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tap1P21958 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tap1P21958 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tap1P21958 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tap1P21958 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tap1P21958 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tap1P21958 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tap1P21958 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Tap1P21958 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Tap1P21958 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tap1P21958 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tap1P21958 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tap1P21958 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tap1P21958 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tap1P21958 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tap1P21958 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tap1P21958 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tap1P21958 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tap1P21958 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tap1P21958 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tap1P21958 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tap1P21958 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tap1P21958 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tap1P21958 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tap1P21958 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Tap1P21958 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tap1P21958 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tap1P21958 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tap1P21958 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tap1P21958 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tap1P21958 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tap1P21958 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tap1P21958 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tap1P21958 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tap1P21958 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tap1P21958 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tap1P21958 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tap1P21958 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tap1P21958 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tap1P21958 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tap1P21958 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tap1P21958 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tap1P21958 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tap1P21958 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tap1P21958 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tap1P21958 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tap1P21958 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tap1P21958 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tap1P21958 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tap1P21958 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tap1P21958 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tap1P21958 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tap1P21958 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tap1P21958 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tap1P21958 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tap1P21958 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tap1P21958 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tap1P21958 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tap1P21958 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tap1P21958 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tap1P21958 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tap1P21958 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tap1P21958 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tap1P21958 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tap1P21958 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.4 ms