Protein–RNA interactions for Protein: P18828

Sdc1, Syndecan-1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc1P18828 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sdc1P18828 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sdc1P18828 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sdc1P18828 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sdc1P18828 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sdc1P18828 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sdc1P18828 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sdc1P18828 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sdc1P18828 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sdc1P18828 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sdc1P18828 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sdc1P18828 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sdc1P18828 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sdc1P18828 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sdc1P18828 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sdc1P18828 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sdc1P18828 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sdc1P18828 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sdc1P18828 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sdc1P18828 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sdc1P18828 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sdc1P18828 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sdc1P18828 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sdc1P18828 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sdc1P18828 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sdc1P18828 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sdc1P18828 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sdc1P18828 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sdc1P18828 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sdc1P18828 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sdc1P18828 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sdc1P18828 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sdc1P18828 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sdc1P18828 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sdc1P18828 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sdc1P18828 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sdc1P18828 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sdc1P18828 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sdc1P18828 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sdc1P18828 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sdc1P18828 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sdc1P18828 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sdc1P18828 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sdc1P18828 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sdc1P18828 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sdc1P18828 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sdc1P18828 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sdc1P18828 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sdc1P18828 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sdc1P18828 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sdc1P18828 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sdc1P18828 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sdc1P18828 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sdc1P18828 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sdc1P18828 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sdc1P18828 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sdc1P18828 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sdc1P18828 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sdc1P18828 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sdc1P18828 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sdc1P18828 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sdc1P18828 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sdc1P18828 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sdc1P18828 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sdc1P18828 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sdc1P18828 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sdc1P18828 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sdc1P18828 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sdc1P18828 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sdc1P18828 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sdc1P18828 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sdc1P18828 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sdc1P18828 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sdc1P18828 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sdc1P18828 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sdc1P18828 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Sdc1P18828 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sdc1P18828 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Sdc1P18828 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sdc1P18828 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sdc1P18828 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sdc1P18828 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sdc1P18828 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sdc1P18828 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sdc1P18828 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sdc1P18828 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sdc1P18828 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sdc1P18828 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sdc1P18828 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sdc1P18828 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sdc1P18828 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sdc1P18828 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sdc1P18828 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sdc1P18828 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sdc1P18828 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sdc1P18828 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Sdc1P18828 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sdc1P18828 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sdc1P18828 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sdc1P18828 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms