Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rps6ka1P18653 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rps6ka1P18653 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rps6ka1P18653 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rps6ka1P18653 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rps6ka1P18653 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rps6ka1P18653 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rps6ka1P18653 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rps6ka1P18653 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rps6ka1P18653 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rps6ka1P18653 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rps6ka1P18653 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rps6ka1P18653 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rps6ka1P18653 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rps6ka1P18653 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rps6ka1P18653 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rps6ka1P18653 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rps6ka1P18653 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rps6ka1P18653 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rps6ka1P18653 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rps6ka1P18653 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rps6ka1P18653 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rps6ka1P18653 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rps6ka1P18653 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rps6ka1P18653 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rps6ka1P18653 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rps6ka1P18653 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rps6ka1P18653 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rps6ka1P18653 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rps6ka1P18653 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rps6ka1P18653 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rps6ka1P18653 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rps6ka1P18653 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rps6ka1P18653 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rps6ka1P18653 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rps6ka1P18653 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rps6ka1P18653 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rps6ka1P18653 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rps6ka1P18653 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rps6ka1P18653 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rps6ka1P18653 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rps6ka1P18653 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rps6ka1P18653 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rps6ka1P18653 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rps6ka1P18653 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rps6ka1P18653 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rps6ka1P18653 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rps6ka1P18653 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rps6ka1P18653 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rps6ka1P18653 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rps6ka1P18653 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rps6ka1P18653 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rps6ka1P18653 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rps6ka1P18653 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rps6ka1P18653 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rps6ka1P18653 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rps6ka1P18653 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rps6ka1P18653 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rps6ka1P18653 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rps6ka1P18653 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rps6ka1P18653 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rps6ka1P18653 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rps6ka1P18653 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rps6ka1P18653 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rps6ka1P18653 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rps6ka1P18653 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rps6ka1P18653 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rps6ka1P18653 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rps6ka1P18653 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rps6ka1P18653 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rps6ka1P18653 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rps6ka1P18653 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rps6ka1P18653 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rps6ka1P18653 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rps6ka1P18653 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rps6ka1P18653 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rps6ka1P18653 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rps6ka1P18653 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rps6ka1P18653 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rps6ka1P18653 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rps6ka1P18653 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rps6ka1P18653 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rps6ka1P18653 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rps6ka1P18653 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rps6ka1P18653 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rps6ka1P18653 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rps6ka1P18653 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rps6ka1P18653 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rps6ka1P18653 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rps6ka1P18653 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rps6ka1P18653 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rps6ka1P18653 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rps6ka1P18653 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rps6ka1P18653 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rps6ka1P18653 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rps6ka1P18653 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rps6ka1P18653 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rps6ka1P18653 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rps6ka1P18653 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rps6ka1P18653 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms