Protein–RNA interactions for Protein: P16015

Ca3, Carbonic anhydrase 3, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ca3P16015 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ca3P16015 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ca3P16015 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ca3P16015 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ca3P16015 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ca3P16015 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ca3P16015 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ca3P16015 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ca3P16015 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ca3P16015 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ca3P16015 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ca3P16015 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Ca3P16015 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ca3P16015 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ca3P16015 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ca3P16015 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ca3P16015 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ca3P16015 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ca3P16015 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ca3P16015 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ca3P16015 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ca3P16015 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ca3P16015 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ca3P16015 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ca3P16015 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ca3P16015 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ca3P16015 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ca3P16015 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ca3P16015 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ca3P16015 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ca3P16015 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ca3P16015 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ca3P16015 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ca3P16015 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ca3P16015 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ca3P16015 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ca3P16015 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ca3P16015 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ca3P16015 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ca3P16015 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ca3P16015 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ca3P16015 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ca3P16015 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ca3P16015 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ca3P16015 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ca3P16015 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ca3P16015 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ca3P16015 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ca3P16015 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ca3P16015 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ca3P16015 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ca3P16015 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ca3P16015 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ca3P16015 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ca3P16015 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ca3P16015 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ca3P16015 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ca3P16015 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ca3P16015 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ca3P16015 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ca3P16015 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ca3P16015 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ca3P16015 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ca3P16015 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ca3P16015 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ca3P16015 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ca3P16015 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ca3P16015 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ca3P16015 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ca3P16015 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ca3P16015 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ca3P16015 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ca3P16015 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ca3P16015 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ca3P16015 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ca3P16015 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ca3P16015 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ca3P16015 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ca3P16015 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ca3P16015 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ca3P16015 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ca3P16015 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ca3P16015 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ca3P16015 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ca3P16015 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ca3P16015 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ca3P16015 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ca3P16015 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ca3P16015 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ca3P16015 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ca3P16015 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ca3P16015 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ca3P16015 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ca3P16015 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ca3P16015 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ca3P16015 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ca3P16015 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ca3P16015 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ca3P16015 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ca3P16015 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms