Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vpreb2P13373 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vpreb2P13373 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vpreb2P13373 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vpreb2P13373 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Vpreb2P13373 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vpreb2P13373 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vpreb2P13373 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Vpreb2P13373 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vpreb2P13373 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vpreb2P13373 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vpreb2P13373 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vpreb2P13373 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vpreb2P13373 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vpreb2P13373 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vpreb2P13373 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vpreb2P13373 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vpreb2P13373 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vpreb2P13373 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vpreb2P13373 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vpreb2P13373 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vpreb2P13373 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vpreb2P13373 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vpreb2P13373 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vpreb2P13373 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vpreb2P13373 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Vpreb2P13373 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vpreb2P13373 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vpreb2P13373 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vpreb2P13373 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vpreb2P13373 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vpreb2P13373 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vpreb2P13373 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vpreb2P13373 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vpreb2P13373 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vpreb2P13373 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vpreb2P13373 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vpreb2P13373 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vpreb2P13373 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Vpreb2P13373 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vpreb2P13373 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vpreb2P13373 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vpreb2P13373 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vpreb2P13373 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vpreb2P13373 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vpreb2P13373 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vpreb2P13373 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vpreb2P13373 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vpreb2P13373 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vpreb2P13373 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Vpreb2P13373 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vpreb2P13373 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vpreb2P13373 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vpreb2P13373 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vpreb2P13373 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vpreb2P13373 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vpreb2P13373 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vpreb2P13373 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vpreb2P13373 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vpreb2P13373 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vpreb2P13373 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vpreb2P13373 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vpreb2P13373 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vpreb2P13373 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vpreb2P13373 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vpreb2P13373 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vpreb2P13373 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vpreb2P13373 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vpreb2P13373 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vpreb2P13373 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vpreb2P13373 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vpreb2P13373 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vpreb2P13373 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vpreb2P13373 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vpreb2P13373 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vpreb2P13373 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vpreb2P13373 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vpreb2P13373 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vpreb2P13373 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vpreb2P13373 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vpreb2P13373 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vpreb2P13373 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vpreb2P13373 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vpreb2P13373 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Vpreb2P13373 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Vpreb2P13373 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Vpreb2P13373 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Vpreb2P13373 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Vpreb2P13373 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Vpreb2P13373 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Vpreb2P13373 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Vpreb2P13373 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Vpreb2P13373 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Vpreb2P13373 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Vpreb2P13373 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vpreb2P13373 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vpreb2P13373 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vpreb2P13373 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vpreb2P13373 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Vpreb2P13373 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms