Protein–RNA interactions for Protein: P11031

Sub1, Activated RNA polymerase II transcriptional coactivator p15, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sub1P11031 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sub1P11031 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sub1P11031 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sub1P11031 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sub1P11031 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sub1P11031 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sub1P11031 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sub1P11031 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sub1P11031 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sub1P11031 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sub1P11031 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sub1P11031 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sub1P11031 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sub1P11031 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sub1P11031 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sub1P11031 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sub1P11031 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sub1P11031 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sub1P11031 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sub1P11031 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sub1P11031 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sub1P11031 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sub1P11031 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sub1P11031 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sub1P11031 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sub1P11031 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sub1P11031 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sub1P11031 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sub1P11031 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sub1P11031 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sub1P11031 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sub1P11031 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sub1P11031 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sub1P11031 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sub1P11031 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sub1P11031 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sub1P11031 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sub1P11031 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sub1P11031 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sub1P11031 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sub1P11031 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sub1P11031 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sub1P11031 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sub1P11031 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sub1P11031 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sub1P11031 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sub1P11031 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sub1P11031 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sub1P11031 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sub1P11031 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sub1P11031 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sub1P11031 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sub1P11031 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sub1P11031 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sub1P11031 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sub1P11031 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sub1P11031 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sub1P11031 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sub1P11031 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sub1P11031 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sub1P11031 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sub1P11031 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sub1P11031 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sub1P11031 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sub1P11031 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sub1P11031 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sub1P11031 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sub1P11031 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sub1P11031 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sub1P11031 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sub1P11031 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sub1P11031 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sub1P11031 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sub1P11031 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sub1P11031 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sub1P11031 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sub1P11031 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sub1P11031 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sub1P11031 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sub1P11031 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sub1P11031 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sub1P11031 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sub1P11031 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sub1P11031 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sub1P11031 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sub1P11031 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sub1P11031 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sub1P11031 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sub1P11031 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sub1P11031 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sub1P11031 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sub1P11031 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sub1P11031 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sub1P11031 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sub1P11031 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sub1P11031 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sub1P11031 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sub1P11031 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sub1P11031 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sub1P11031 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms