Protein–RNA interactions for Protein: P0C7N9

Psmg4, Proteasome assembly chaperone 4, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmg4P0C7N9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmg4P0C7N9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmg4P0C7N9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmg4P0C7N9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmg4P0C7N9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmg4P0C7N9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmg4P0C7N9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmg4P0C7N9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmg4P0C7N9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmg4P0C7N9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmg4P0C7N9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmg4P0C7N9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmg4P0C7N9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmg4P0C7N9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmg4P0C7N9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmg4P0C7N9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmg4P0C7N9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmg4P0C7N9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmg4P0C7N9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmg4P0C7N9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmg4P0C7N9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmg4P0C7N9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psmg4P0C7N9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmg4P0C7N9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmg4P0C7N9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmg4P0C7N9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmg4P0C7N9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmg4P0C7N9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmg4P0C7N9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmg4P0C7N9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmg4P0C7N9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmg4P0C7N9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmg4P0C7N9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmg4P0C7N9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmg4P0C7N9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmg4P0C7N9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmg4P0C7N9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmg4P0C7N9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmg4P0C7N9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmg4P0C7N9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmg4P0C7N9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmg4P0C7N9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmg4P0C7N9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmg4P0C7N9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmg4P0C7N9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmg4P0C7N9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmg4P0C7N9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmg4P0C7N9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmg4P0C7N9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmg4P0C7N9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmg4P0C7N9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmg4P0C7N9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmg4P0C7N9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmg4P0C7N9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmg4P0C7N9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmg4P0C7N9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmg4P0C7N9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmg4P0C7N9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmg4P0C7N9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmg4P0C7N9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmg4P0C7N9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmg4P0C7N9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmg4P0C7N9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmg4P0C7N9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmg4P0C7N9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmg4P0C7N9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmg4P0C7N9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmg4P0C7N9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmg4P0C7N9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psmg4P0C7N9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psmg4P0C7N9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psmg4P0C7N9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psmg4P0C7N9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmg4P0C7N9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmg4P0C7N9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmg4P0C7N9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmg4P0C7N9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmg4P0C7N9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmg4P0C7N9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmg4P0C7N9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmg4P0C7N9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmg4P0C7N9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmg4P0C7N9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmg4P0C7N9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmg4P0C7N9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Psmg4P0C7N9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmg4P0C7N9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Psmg4P0C7N9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmg4P0C7N9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmg4P0C7N9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmg4P0C7N9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmg4P0C7N9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmg4P0C7N9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmg4P0C7N9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmg4P0C7N9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmg4P0C7N9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmg4P0C7N9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmg4P0C7N9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmg4P0C7N9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmg4P0C7N9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms