Protein–RNA interactions for Protein: P06330

Ig heavy chain V region AC38 205.12, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06330 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06330 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06330 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06330 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06330 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06330 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06330 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06330 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06330 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06330 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06330 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P06330 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P06330 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P06330 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P06330 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P06330 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P06330 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P06330 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P06330 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P06330 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P06330 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P06330 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P06330 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P06330 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P06330 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P06330 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P06330 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06330 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06330 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06330 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06330 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06330 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06330 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06330 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06330 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06330 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06330 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06330 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06330 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06330 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06330 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06330 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06330 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06330 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06330 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06330 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06330 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06330 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06330 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06330 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06330 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06330 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06330 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P06330 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P06330 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P06330 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P06330 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P06330 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P06330 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P06330 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P06330 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P06330 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P06330 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P06330 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P06330 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P06330 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06330 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06330 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06330 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06330 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06330 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06330 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06330 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06330 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06330 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06330 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06330 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06330 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06330 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06330 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06330 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06330 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06330 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06330 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06330 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06330 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06330 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06330 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06330 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06330 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06330 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06330 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06330 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06330 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06330 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06330 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06330 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06330 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06330 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06330 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms