Protein–RNA interactions for Protein: P01791

Ig heavy chain V region HPCM6, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01791 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01791 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01791 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01791 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01791 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01791 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01791 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01791 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01791 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01791 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P01791 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01791 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01791 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01791 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01791 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01791 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01791 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01791 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01791 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01791 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01791 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01791 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
P01791 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01791 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01791 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01791 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01791 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01791 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01791 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01791 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01791 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01791 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01791 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01791 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P01791 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01791 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01791 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01791 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01791 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01791 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01791 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01791 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01791 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01791 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01791 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01791 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P01791 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01791 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01791 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01791 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01791 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01791 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01791 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01791 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P01791 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01791 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01791 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01791 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01791 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01791 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01791 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01791 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01791 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01791 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01791 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01791 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01791 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01791 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01791 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01791 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01791 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01791 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01791 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01791 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01791 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01791 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01791 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01791 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01791 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01791 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01791 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01791 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01791 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01791 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01791 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01791 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01791 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01791 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01791 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01791 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01791 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01791 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01791 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01791 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01791 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01791 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01791 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01791 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01791 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01791 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms