Protein–RNA interactions for Protein: P01648

Ig kappa chain V-V region HP 91A3, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01648 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P01648 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P01648 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P01648 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P01648 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P01648 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
P01648 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
P01648 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
P01648 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
P01648 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
P01648 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
P01648 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
P01648 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
P01648 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
P01648 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
P01648 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
P01648 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
P01648 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
P01648 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
P01648 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
P01648 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
P01648 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P01648 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P01648 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P01648 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P01648 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
P01648 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
P01648 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
P01648 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
P01648 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01648 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01648 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01648 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01648 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01648 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01648 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01648 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01648 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01648 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
P01648 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
P01648 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
P01648 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P01648 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P01648 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
P01648 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
P01648 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
P01648 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
P01648 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
P01648 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
P01648 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
P01648 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
P01648 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
P01648 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
P01648 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
P01648 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
P01648 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
P01648 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
P01648 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P01648 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P01648 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P01648 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P01648 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P01648 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P01648 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P01648 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
P01648 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
P01648 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
P01648 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
P01648 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
P01648 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
P01648 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
P01648 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
P01648 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
P01648 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
P01648 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
P01648 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
P01648 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
P01648 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
P01648 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
P01648 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
P01648 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
P01648 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
P01648 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
P01648 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
P01648 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
P01648 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
P01648 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
P01648 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
P01648 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
P01648 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
P01648 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
P01648 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
P01648 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
P01648 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
P01648 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
P01648 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
P01648 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
P01648 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
P01648 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
P01648 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms