Protein–RNA interactions for Protein: O88879

Apaf1, Apoptotic protease-activating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apaf1O88879 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Apaf1O88879 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Apaf1O88879 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Apaf1O88879 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Apaf1O88879 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Apaf1O88879 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Apaf1O88879 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Apaf1O88879 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Apaf1O88879 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Apaf1O88879 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Apaf1O88879 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Apaf1O88879 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Apaf1O88879 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Apaf1O88879 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Apaf1O88879 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Apaf1O88879 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Apaf1O88879 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Apaf1O88879 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Apaf1O88879 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Apaf1O88879 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Apaf1O88879 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Apaf1O88879 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Apaf1O88879 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Apaf1O88879 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Apaf1O88879 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Apaf1O88879 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Apaf1O88879 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Apaf1O88879 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Apaf1O88879 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Apaf1O88879 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Apaf1O88879 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Apaf1O88879 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Apaf1O88879 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Apaf1O88879 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Apaf1O88879 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Apaf1O88879 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Apaf1O88879 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Apaf1O88879 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Apaf1O88879 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Apaf1O88879 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Apaf1O88879 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Apaf1O88879 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Apaf1O88879 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Apaf1O88879 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Apaf1O88879 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Apaf1O88879 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Apaf1O88879 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Apaf1O88879 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Apaf1O88879 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Apaf1O88879 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Apaf1O88879 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Apaf1O88879 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Apaf1O88879 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Apaf1O88879 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Apaf1O88879 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Apaf1O88879 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Apaf1O88879 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Apaf1O88879 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Apaf1O88879 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Apaf1O88879 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Apaf1O88879 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Apaf1O88879 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Apaf1O88879 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Apaf1O88879 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Apaf1O88879 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Apaf1O88879 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Apaf1O88879 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Apaf1O88879 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Apaf1O88879 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Apaf1O88879 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Apaf1O88879 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Apaf1O88879 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Apaf1O88879 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Apaf1O88879 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Apaf1O88879 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Apaf1O88879 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Apaf1O88879 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Apaf1O88879 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Apaf1O88879 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Apaf1O88879 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Apaf1O88879 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Apaf1O88879 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Apaf1O88879 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Apaf1O88879 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Apaf1O88879 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Apaf1O88879 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Apaf1O88879 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Apaf1O88879 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Apaf1O88879 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Apaf1O88879 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Apaf1O88879 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Apaf1O88879 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Apaf1O88879 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Apaf1O88879 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Apaf1O88879 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Apaf1O88879 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Apaf1O88879 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Apaf1O88879 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Apaf1O88879 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Apaf1O88879 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms