Protein–RNA interactions for Protein: O88879

Apaf1, Apoptotic protease-activating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apaf1O88879 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Apaf1O88879 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Apaf1O88879 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Apaf1O88879 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Apaf1O88879 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Apaf1O88879 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Apaf1O88879 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Apaf1O88879 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Apaf1O88879 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Apaf1O88879 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Apaf1O88879 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Apaf1O88879 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Apaf1O88879 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Apaf1O88879 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Apaf1O88879 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Apaf1O88879 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Apaf1O88879 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Apaf1O88879 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Apaf1O88879 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Apaf1O88879 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Apaf1O88879 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Apaf1O88879 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Apaf1O88879 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Apaf1O88879 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Apaf1O88879 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Apaf1O88879 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Apaf1O88879 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Apaf1O88879 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Apaf1O88879 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Apaf1O88879 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Apaf1O88879 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Apaf1O88879 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Apaf1O88879 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Apaf1O88879 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Apaf1O88879 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Apaf1O88879 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Apaf1O88879 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Apaf1O88879 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Apaf1O88879 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Apaf1O88879 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Apaf1O88879 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Apaf1O88879 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Apaf1O88879 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Apaf1O88879 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Apaf1O88879 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Apaf1O88879 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Apaf1O88879 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Apaf1O88879 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Apaf1O88879 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Apaf1O88879 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Apaf1O88879 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Apaf1O88879 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Apaf1O88879 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Apaf1O88879 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Apaf1O88879 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Apaf1O88879 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Apaf1O88879 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Apaf1O88879 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Apaf1O88879 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Apaf1O88879 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Apaf1O88879 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Apaf1O88879 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Apaf1O88879 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Apaf1O88879 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Apaf1O88879 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Apaf1O88879 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Apaf1O88879 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Apaf1O88879 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Apaf1O88879 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Apaf1O88879 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Apaf1O88879 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Apaf1O88879 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Apaf1O88879 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Apaf1O88879 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Apaf1O88879 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Apaf1O88879 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Apaf1O88879 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Apaf1O88879 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Apaf1O88879 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Apaf1O88879 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Apaf1O88879 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Apaf1O88879 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Apaf1O88879 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Apaf1O88879 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Apaf1O88879 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Apaf1O88879 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Apaf1O88879 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Apaf1O88879 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Apaf1O88879 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Apaf1O88879 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Apaf1O88879 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Apaf1O88879 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Apaf1O88879 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Apaf1O88879 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Apaf1O88879 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Apaf1O88879 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Apaf1O88879 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Apaf1O88879 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Apaf1O88879 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Apaf1O88879 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms