Protein–RNA interactions for Protein: O88485

Dync1i1, Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dync1i1O88485 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dync1i1O88485 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dync1i1O88485 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dync1i1O88485 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dync1i1O88485 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Dync1i1O88485 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dync1i1O88485 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dync1i1O88485 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Dync1i1O88485 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dync1i1O88485 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dync1i1O88485 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dync1i1O88485 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dync1i1O88485 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dync1i1O88485 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Dync1i1O88485 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dync1i1O88485 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dync1i1O88485 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dync1i1O88485 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dync1i1O88485 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dync1i1O88485 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dync1i1O88485 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dync1i1O88485 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dync1i1O88485 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dync1i1O88485 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dync1i1O88485 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dync1i1O88485 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dync1i1O88485 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dync1i1O88485 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dync1i1O88485 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dync1i1O88485 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dync1i1O88485 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dync1i1O88485 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dync1i1O88485 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dync1i1O88485 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Dync1i1O88485 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dync1i1O88485 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dync1i1O88485 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dync1i1O88485 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dync1i1O88485 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dync1i1O88485 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dync1i1O88485 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dync1i1O88485 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dync1i1O88485 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dync1i1O88485 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Dync1i1O88485 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dync1i1O88485 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dync1i1O88485 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dync1i1O88485 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dync1i1O88485 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dync1i1O88485 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dync1i1O88485 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dync1i1O88485 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dync1i1O88485 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dync1i1O88485 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dync1i1O88485 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dync1i1O88485 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dync1i1O88485 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dync1i1O88485 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dync1i1O88485 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dync1i1O88485 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dync1i1O88485 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dync1i1O88485 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dync1i1O88485 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dync1i1O88485 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dync1i1O88485 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dync1i1O88485 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dync1i1O88485 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Dync1i1O88485 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dync1i1O88485 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dync1i1O88485 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dync1i1O88485 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dync1i1O88485 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dync1i1O88485 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dync1i1O88485 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dync1i1O88485 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dync1i1O88485 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dync1i1O88485 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dync1i1O88485 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dync1i1O88485 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dync1i1O88485 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dync1i1O88485 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dync1i1O88485 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dync1i1O88485 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dync1i1O88485 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dync1i1O88485 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Dync1i1O88485 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dync1i1O88485 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dync1i1O88485 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Dync1i1O88485 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dync1i1O88485 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dync1i1O88485 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dync1i1O88485 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dync1i1O88485 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Dync1i1O88485 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dync1i1O88485 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dync1i1O88485 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dync1i1O88485 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dync1i1O88485 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dync1i1O88485 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dync1i1O88485 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms