Protein–RNA interactions for Protein: O70546

Kdm6a, Lysine-specific demethylase 6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm6aO70546 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Kdm6aO70546 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Kdm6aO70546 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Kdm6aO70546 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Kdm6aO70546 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Kdm6aO70546 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Kdm6aO70546 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Kdm6aO70546 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Kdm6aO70546 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Kdm6aO70546 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Kdm6aO70546 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Kdm6aO70546 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Kdm6aO70546 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Kdm6aO70546 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Kdm6aO70546 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Kdm6aO70546 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Kdm6aO70546 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Kdm6aO70546 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Kdm6aO70546 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Kdm6aO70546 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Kdm6aO70546 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Kdm6aO70546 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Kdm6aO70546 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Kdm6aO70546 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Kdm6aO70546 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Kdm6aO70546 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Kdm6aO70546 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Kdm6aO70546 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Kdm6aO70546 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Kdm6aO70546 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Kdm6aO70546 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Kdm6aO70546 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Kdm6aO70546 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Kdm6aO70546 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Kdm6aO70546 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Kdm6aO70546 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Kdm6aO70546 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Kdm6aO70546 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Kdm6aO70546 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Kdm6aO70546 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Kdm6aO70546 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Kdm6aO70546 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Kdm6aO70546 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Kdm6aO70546 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Kdm6aO70546 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Kdm6aO70546 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Kdm6aO70546 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Kdm6aO70546 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Kdm6aO70546 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Kdm6aO70546 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Kdm6aO70546 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Kdm6aO70546 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Kdm6aO70546 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Kdm6aO70546 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Kdm6aO70546 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Kdm6aO70546 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Kdm6aO70546 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Kdm6aO70546 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Kdm6aO70546 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Kdm6aO70546 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Kdm6aO70546 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Kdm6aO70546 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Kdm6aO70546 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Kdm6aO70546 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kdm6aO70546 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kdm6aO70546 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kdm6aO70546 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kdm6aO70546 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kdm6aO70546 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kdm6aO70546 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kdm6aO70546 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kdm6aO70546 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kdm6aO70546 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kdm6aO70546 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kdm6aO70546 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kdm6aO70546 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kdm6aO70546 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Kdm6aO70546 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
Kdm6aO70546 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Kdm6aO70546 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Kdm6aO70546 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Kdm6aO70546 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Kdm6aO70546 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Kdm6aO70546 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Kdm6aO70546 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Kdm6aO70546 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Kdm6aO70546 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Kdm6aO70546 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Kdm6aO70546 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Kdm6aO70546 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Kdm6aO70546 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Kdm6aO70546 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Kdm6aO70546 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Kdm6aO70546 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Kdm6aO70546 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Kdm6aO70546 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Kdm6aO70546 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Kdm6aO70546 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Kdm6aO70546 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Kdm6aO70546 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms