Protein–RNA interactions for Protein: O55222

Ilk, Integrin-linked protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IlkO55222 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IlkO55222 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IlkO55222 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IlkO55222 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IlkO55222 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IlkO55222 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IlkO55222 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IlkO55222 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IlkO55222 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IlkO55222 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IlkO55222 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
IlkO55222 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IlkO55222 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IlkO55222 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IlkO55222 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
IlkO55222 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IlkO55222 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IlkO55222 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IlkO55222 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IlkO55222 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
IlkO55222 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IlkO55222 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IlkO55222 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IlkO55222 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IlkO55222 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IlkO55222 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IlkO55222 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IlkO55222 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IlkO55222 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IlkO55222 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IlkO55222 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IlkO55222 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IlkO55222 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IlkO55222 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IlkO55222 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IlkO55222 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IlkO55222 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IlkO55222 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IlkO55222 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IlkO55222 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IlkO55222 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IlkO55222 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IlkO55222 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IlkO55222 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IlkO55222 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
IlkO55222 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
IlkO55222 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
IlkO55222 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IlkO55222 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IlkO55222 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IlkO55222 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IlkO55222 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IlkO55222 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IlkO55222 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IlkO55222 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IlkO55222 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IlkO55222 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IlkO55222 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IlkO55222 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IlkO55222 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IlkO55222 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IlkO55222 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IlkO55222 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IlkO55222 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IlkO55222 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IlkO55222 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IlkO55222 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IlkO55222 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
IlkO55222 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IlkO55222 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IlkO55222 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IlkO55222 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IlkO55222 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IlkO55222 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IlkO55222 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IlkO55222 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IlkO55222 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IlkO55222 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IlkO55222 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IlkO55222 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IlkO55222 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IlkO55222 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IlkO55222 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IlkO55222 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
IlkO55222 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IlkO55222 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IlkO55222 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IlkO55222 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IlkO55222 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IlkO55222 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
IlkO55222 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IlkO55222 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
IlkO55222 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
IlkO55222 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IlkO55222 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IlkO55222 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IlkO55222 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
IlkO55222 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IlkO55222 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
IlkO55222 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms