Protein–RNA interactions for Protein: O55123

Mmp10, Stromelysin-2, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp10O55123 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mmp10O55123 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mmp10O55123 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Mmp10O55123 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mmp10O55123 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mmp10O55123 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mmp10O55123 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mmp10O55123 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mmp10O55123 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mmp10O55123 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mmp10O55123 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mmp10O55123 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mmp10O55123 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mmp10O55123 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mmp10O55123 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mmp10O55123 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mmp10O55123 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mmp10O55123 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Mmp10O55123 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mmp10O55123 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mmp10O55123 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mmp10O55123 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mmp10O55123 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mmp10O55123 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mmp10O55123 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mmp10O55123 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mmp10O55123 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mmp10O55123 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mmp10O55123 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Mmp10O55123 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mmp10O55123 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mmp10O55123 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mmp10O55123 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mmp10O55123 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mmp10O55123 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mmp10O55123 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mmp10O55123 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mmp10O55123 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Mmp10O55123 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mmp10O55123 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mmp10O55123 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mmp10O55123 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mmp10O55123 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mmp10O55123 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Mmp10O55123 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mmp10O55123 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Mmp10O55123 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mmp10O55123 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mmp10O55123 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mmp10O55123 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mmp10O55123 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mmp10O55123 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Mmp10O55123 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mmp10O55123 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mmp10O55123 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mmp10O55123 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mmp10O55123 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mmp10O55123 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mmp10O55123 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mmp10O55123 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mmp10O55123 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Mmp10O55123 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Mmp10O55123 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mmp10O55123 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mmp10O55123 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mmp10O55123 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Mmp10O55123 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mmp10O55123 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mmp10O55123 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mmp10O55123 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mmp10O55123 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mmp10O55123 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Mmp10O55123 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mmp10O55123 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mmp10O55123 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mmp10O55123 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mmp10O55123 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mmp10O55123 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mmp10O55123 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mmp10O55123 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mmp10O55123 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mmp10O55123 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mmp10O55123 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mmp10O55123 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Mmp10O55123 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mmp10O55123 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mmp10O55123 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mmp10O55123 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mmp10O55123 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Mmp10O55123 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mmp10O55123 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mmp10O55123 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mmp10O55123 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mmp10O55123 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mmp10O55123 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mmp10O55123 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mmp10O55123 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mmp10O55123 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mmp10O55123 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mmp10O55123 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms