Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syngr1O55100 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syngr1O55100 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syngr1O55100 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syngr1O55100 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syngr1O55100 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Syngr1O55100 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syngr1O55100 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Syngr1O55100 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Syngr1O55100 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Syngr1O55100 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Syngr1O55100 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Syngr1O55100 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Syngr1O55100 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Syngr1O55100 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Syngr1O55100 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Syngr1O55100 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syngr1O55100 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syngr1O55100 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syngr1O55100 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Syngr1O55100 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syngr1O55100 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syngr1O55100 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syngr1O55100 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syngr1O55100 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Syngr1O55100 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Syngr1O55100 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Syngr1O55100 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Syngr1O55100 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Syngr1O55100 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Syngr1O55100 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Syngr1O55100 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Syngr1O55100 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Syngr1O55100 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syngr1O55100 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syngr1O55100 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syngr1O55100 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syngr1O55100 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Syngr1O55100 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syngr1O55100 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syngr1O55100 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syngr1O55100 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syngr1O55100 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syngr1O55100 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syngr1O55100 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syngr1O55100 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Syngr1O55100 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syngr1O55100 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syngr1O55100 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syngr1O55100 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syngr1O55100 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syngr1O55100 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Syngr1O55100 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Syngr1O55100 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Syngr1O55100 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Syngr1O55100 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Syngr1O55100 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Syngr1O55100 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Syngr1O55100 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Syngr1O55100 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syngr1O55100 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syngr1O55100 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syngr1O55100 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syngr1O55100 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syngr1O55100 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syngr1O55100 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syngr1O55100 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Syngr1O55100 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Syngr1O55100 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Syngr1O55100 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Syngr1O55100 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Syngr1O55100 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Syngr1O55100 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Syngr1O55100 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Syngr1O55100 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Syngr1O55100 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Syngr1O55100 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Syngr1O55100 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Syngr1O55100 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Syngr1O55100 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Syngr1O55100 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Syngr1O55100 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Syngr1O55100 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Syngr1O55100 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Syngr1O55100 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Syngr1O55100 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Syngr1O55100 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Syngr1O55100 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Syngr1O55100 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Syngr1O55100 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Syngr1O55100 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Syngr1O55100 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Syngr1O55100 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Syngr1O55100 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Syngr1O55100 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Syngr1O55100 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Syngr1O55100 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Syngr1O55100 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Syngr1O55100 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Syngr1O55100 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms