Protein–RNA interactions for Protein: O54839

Eomes, Eomesodermin homolog, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EomesO54839 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EomesO54839 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EomesO54839 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EomesO54839 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EomesO54839 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EomesO54839 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EomesO54839 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EomesO54839 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EomesO54839 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EomesO54839 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EomesO54839 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EomesO54839 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EomesO54839 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EomesO54839 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EomesO54839 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EomesO54839 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EomesO54839 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EomesO54839 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EomesO54839 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EomesO54839 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EomesO54839 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EomesO54839 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EomesO54839 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EomesO54839 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EomesO54839 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EomesO54839 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EomesO54839 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EomesO54839 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EomesO54839 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EomesO54839 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EomesO54839 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EomesO54839 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EomesO54839 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EomesO54839 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EomesO54839 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EomesO54839 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EomesO54839 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EomesO54839 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EomesO54839 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EomesO54839 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EomesO54839 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EomesO54839 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EomesO54839 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EomesO54839 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EomesO54839 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EomesO54839 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EomesO54839 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EomesO54839 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EomesO54839 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EomesO54839 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EomesO54839 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EomesO54839 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EomesO54839 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EomesO54839 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EomesO54839 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
EomesO54839 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EomesO54839 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EomesO54839 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EomesO54839 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EomesO54839 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EomesO54839 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EomesO54839 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EomesO54839 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EomesO54839 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EomesO54839 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EomesO54839 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EomesO54839 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EomesO54839 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EomesO54839 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EomesO54839 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EomesO54839 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EomesO54839 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EomesO54839 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EomesO54839 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EomesO54839 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EomesO54839 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
EomesO54839 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EomesO54839 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EomesO54839 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
EomesO54839 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EomesO54839 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EomesO54839 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EomesO54839 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EomesO54839 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EomesO54839 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EomesO54839 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EomesO54839 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
EomesO54839 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EomesO54839 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EomesO54839 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EomesO54839 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22■■□□□ 1.11
EomesO54839 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EomesO54839 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EomesO54839 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EomesO54839 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EomesO54839 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EomesO54839 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EomesO54839 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EomesO54839 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
EomesO54839 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms