Protein–RNA interactions for Protein: O54714

Pias3, E3 SUMO-protein ligase PIAS3, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pias3O54714 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pias3O54714 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pias3O54714 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pias3O54714 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pias3O54714 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pias3O54714 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pias3O54714 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pias3O54714 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pias3O54714 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pias3O54714 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pias3O54714 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pias3O54714 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pias3O54714 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pias3O54714 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pias3O54714 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pias3O54714 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pias3O54714 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pias3O54714 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pias3O54714 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pias3O54714 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pias3O54714 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Pias3O54714 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pias3O54714 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pias3O54714 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pias3O54714 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Pias3O54714 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pias3O54714 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Pias3O54714 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Pias3O54714 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Pias3O54714 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pias3O54714 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pias3O54714 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Pias3O54714 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pias3O54714 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pias3O54714 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pias3O54714 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pias3O54714 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pias3O54714 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pias3O54714 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pias3O54714 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pias3O54714 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pias3O54714 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Pias3O54714 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Pias3O54714 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pias3O54714 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pias3O54714 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pias3O54714 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pias3O54714 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pias3O54714 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pias3O54714 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pias3O54714 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pias3O54714 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pias3O54714 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pias3O54714 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pias3O54714 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pias3O54714 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pias3O54714 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pias3O54714 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pias3O54714 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pias3O54714 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pias3O54714 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pias3O54714 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Pias3O54714 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pias3O54714 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pias3O54714 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pias3O54714 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pias3O54714 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pias3O54714 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pias3O54714 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pias3O54714 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pias3O54714 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Pias3O54714 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pias3O54714 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pias3O54714 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pias3O54714 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pias3O54714 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pias3O54714 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pias3O54714 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pias3O54714 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pias3O54714 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Pias3O54714 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pias3O54714 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pias3O54714 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pias3O54714 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pias3O54714 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pias3O54714 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pias3O54714 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pias3O54714 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pias3O54714 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pias3O54714 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pias3O54714 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pias3O54714 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Pias3O54714 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pias3O54714 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pias3O54714 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pias3O54714 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pias3O54714 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Pias3O54714 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Pias3O54714 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pias3O54714 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms