Protein–RNA interactions for Protein: O35739

Klf9, Krueppel-like factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf9O35739 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klf9O35739 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klf9O35739 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klf9O35739 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klf9O35739 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klf9O35739 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klf9O35739 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klf9O35739 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klf9O35739 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klf9O35739 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klf9O35739 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klf9O35739 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klf9O35739 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klf9O35739 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klf9O35739 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klf9O35739 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klf9O35739 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klf9O35739 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klf9O35739 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klf9O35739 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klf9O35739 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klf9O35739 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klf9O35739 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klf9O35739 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Klf9O35739 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klf9O35739 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klf9O35739 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klf9O35739 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klf9O35739 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klf9O35739 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klf9O35739 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klf9O35739 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klf9O35739 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klf9O35739 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klf9O35739 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klf9O35739 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klf9O35739 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klf9O35739 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Klf9O35739 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klf9O35739 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klf9O35739 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klf9O35739 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klf9O35739 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klf9O35739 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klf9O35739 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klf9O35739 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf9O35739 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf9O35739 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf9O35739 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf9O35739 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf9O35739 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf9O35739 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf9O35739 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf9O35739 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klf9O35739 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klf9O35739 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klf9O35739 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Klf9O35739 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klf9O35739 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klf9O35739 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klf9O35739 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klf9O35739 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf9O35739 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf9O35739 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf9O35739 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf9O35739 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf9O35739 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf9O35739 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf9O35739 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf9O35739 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf9O35739 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf9O35739 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf9O35739 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf9O35739 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf9O35739 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klf9O35739 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klf9O35739 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klf9O35739 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klf9O35739 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klf9O35739 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klf9O35739 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Klf9O35739 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Klf9O35739 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Klf9O35739 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klf9O35739 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klf9O35739 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klf9O35739 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klf9O35739 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klf9O35739 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klf9O35739 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klf9O35739 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klf9O35739 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klf9O35739 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klf9O35739 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klf9O35739 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Klf9O35739 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klf9O35739 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klf9O35739 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klf9O35739 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Klf9O35739 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms