Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Polr1aO35134 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Polr1aO35134 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Polr1aO35134 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Polr1aO35134 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Polr1aO35134 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Polr1aO35134 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Polr1aO35134 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Polr1aO35134 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Polr1aO35134 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Polr1aO35134 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Polr1aO35134 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC33.45■■■□□ 2.94
Polr1aO35134 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Polr1aO35134 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Polr1aO35134 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Polr1aO35134 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Polr1aO35134 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Polr1aO35134 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Polr1aO35134 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Polr1aO35134 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Polr1aO35134 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Polr1aO35134 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Polr1aO35134 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Polr1aO35134 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Polr1aO35134 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Polr1aO35134 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Polr1aO35134 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Polr1aO35134 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Polr1aO35134 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Polr1aO35134 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Polr1aO35134 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Polr1aO35134 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Polr1aO35134 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
Polr1aO35134 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Polr1aO35134 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Polr1aO35134 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Polr1aO35134 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Polr1aO35134 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Polr1aO35134 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Polr1aO35134 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Polr1aO35134 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Polr1aO35134 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Polr1aO35134 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Polr1aO35134 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Polr1aO35134 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Polr1aO35134 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Polr1aO35134 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Polr1aO35134 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Polr1aO35134 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Polr1aO35134 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Polr1aO35134 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Polr1aO35134 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Polr1aO35134 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Polr1aO35134 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Polr1aO35134 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Polr1aO35134 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Polr1aO35134 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Polr1aO35134 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Polr1aO35134 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Polr1aO35134 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
Polr1aO35134 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Polr1aO35134 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Polr1aO35134 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
Polr1aO35134 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Polr1aO35134 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Polr1aO35134 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Polr1aO35134 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Polr1aO35134 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Polr1aO35134 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Polr1aO35134 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Polr1aO35134 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Polr1aO35134 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Polr1aO35134 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Polr1aO35134 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Polr1aO35134 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Polr1aO35134 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Polr1aO35134 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
Polr1aO35134 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Polr1aO35134 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Polr1aO35134 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Polr1aO35134 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Polr1aO35134 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Polr1aO35134 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Polr1aO35134 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Polr1aO35134 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Polr1aO35134 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Polr1aO35134 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
Polr1aO35134 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Polr1aO35134 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Polr1aO35134 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Polr1aO35134 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Polr1aO35134 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Polr1aO35134 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Polr1aO35134 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Polr1aO35134 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
Polr1aO35134 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
Polr1aO35134 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Polr1aO35134 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Polr1aO35134 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Polr1aO35134 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms