Protein–RNA interactions for Protein: O08574

Mesp2, Mesoderm posterior protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp2O08574 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mesp2O08574 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mesp2O08574 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mesp2O08574 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mesp2O08574 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mesp2O08574 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mesp2O08574 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mesp2O08574 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mesp2O08574 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mesp2O08574 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mesp2O08574 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mesp2O08574 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mesp2O08574 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mesp2O08574 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mesp2O08574 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mesp2O08574 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mesp2O08574 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mesp2O08574 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mesp2O08574 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mesp2O08574 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Mesp2O08574 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Mesp2O08574 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mesp2O08574 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mesp2O08574 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mesp2O08574 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mesp2O08574 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mesp2O08574 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mesp2O08574 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mesp2O08574 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mesp2O08574 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mesp2O08574 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mesp2O08574 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mesp2O08574 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mesp2O08574 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mesp2O08574 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mesp2O08574 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Mesp2O08574 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mesp2O08574 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mesp2O08574 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mesp2O08574 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mesp2O08574 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mesp2O08574 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mesp2O08574 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mesp2O08574 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mesp2O08574 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mesp2O08574 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mesp2O08574 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mesp2O08574 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mesp2O08574 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mesp2O08574 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mesp2O08574 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mesp2O08574 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mesp2O08574 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mesp2O08574 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mesp2O08574 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mesp2O08574 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mesp2O08574 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mesp2O08574 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mesp2O08574 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mesp2O08574 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mesp2O08574 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mesp2O08574 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mesp2O08574 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mesp2O08574 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mesp2O08574 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mesp2O08574 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mesp2O08574 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mesp2O08574 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mesp2O08574 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mesp2O08574 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mesp2O08574 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mesp2O08574 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mesp2O08574 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mesp2O08574 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Mesp2O08574 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mesp2O08574 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mesp2O08574 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mesp2O08574 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mesp2O08574 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mesp2O08574 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mesp2O08574 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mesp2O08574 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mesp2O08574 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mesp2O08574 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mesp2O08574 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mesp2O08574 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mesp2O08574 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mesp2O08574 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mesp2O08574 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mesp2O08574 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mesp2O08574 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mesp2O08574 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mesp2O08574 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mesp2O08574 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mesp2O08574 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mesp2O08574 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mesp2O08574 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mesp2O08574 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mesp2O08574 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mesp2O08574 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms