Protein–RNA interactions for Protein: J3QP07

B020004C17Rik, RIKEN cDNA B020004C17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B020004C17RikJ3QP07 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
B020004C17RikJ3QP07 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
B020004C17RikJ3QP07 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
B020004C17RikJ3QP07 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
B020004C17RikJ3QP07 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
B020004C17RikJ3QP07 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
B020004C17RikJ3QP07 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
B020004C17RikJ3QP07 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
B020004C17RikJ3QP07 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
B020004C17RikJ3QP07 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
B020004C17RikJ3QP07 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
B020004C17RikJ3QP07 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
B020004C17RikJ3QP07 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
B020004C17RikJ3QP07 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
B020004C17RikJ3QP07 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
B020004C17RikJ3QP07 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
B020004C17RikJ3QP07 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
B020004C17RikJ3QP07 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
B020004C17RikJ3QP07 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
B020004C17RikJ3QP07 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
B020004C17RikJ3QP07 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
B020004C17RikJ3QP07 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
B020004C17RikJ3QP07 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
B020004C17RikJ3QP07 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
B020004C17RikJ3QP07 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
B020004C17RikJ3QP07 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
B020004C17RikJ3QP07 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
B020004C17RikJ3QP07 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
B020004C17RikJ3QP07 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
B020004C17RikJ3QP07 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
B020004C17RikJ3QP07 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
B020004C17RikJ3QP07 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
B020004C17RikJ3QP07 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
B020004C17RikJ3QP07 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
B020004C17RikJ3QP07 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
B020004C17RikJ3QP07 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
B020004C17RikJ3QP07 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
B020004C17RikJ3QP07 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
B020004C17RikJ3QP07 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
B020004C17RikJ3QP07 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
B020004C17RikJ3QP07 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
B020004C17RikJ3QP07 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
B020004C17RikJ3QP07 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
B020004C17RikJ3QP07 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
B020004C17RikJ3QP07 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
B020004C17RikJ3QP07 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
B020004C17RikJ3QP07 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
B020004C17RikJ3QP07 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
B020004C17RikJ3QP07 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
B020004C17RikJ3QP07 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
B020004C17RikJ3QP07 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
B020004C17RikJ3QP07 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
B020004C17RikJ3QP07 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
B020004C17RikJ3QP07 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
B020004C17RikJ3QP07 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
B020004C17RikJ3QP07 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
B020004C17RikJ3QP07 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
B020004C17RikJ3QP07 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
B020004C17RikJ3QP07 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
B020004C17RikJ3QP07 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
B020004C17RikJ3QP07 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
B020004C17RikJ3QP07 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
B020004C17RikJ3QP07 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
B020004C17RikJ3QP07 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
B020004C17RikJ3QP07 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
B020004C17RikJ3QP07 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
B020004C17RikJ3QP07 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
B020004C17RikJ3QP07 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
B020004C17RikJ3QP07 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
B020004C17RikJ3QP07 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
B020004C17RikJ3QP07 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
B020004C17RikJ3QP07 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
B020004C17RikJ3QP07 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
B020004C17RikJ3QP07 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
B020004C17RikJ3QP07 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
B020004C17RikJ3QP07 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
B020004C17RikJ3QP07 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
B020004C17RikJ3QP07 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
B020004C17RikJ3QP07 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
B020004C17RikJ3QP07 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
B020004C17RikJ3QP07 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
B020004C17RikJ3QP07 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
B020004C17RikJ3QP07 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
B020004C17RikJ3QP07 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
B020004C17RikJ3QP07 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
B020004C17RikJ3QP07 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
B020004C17RikJ3QP07 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
B020004C17RikJ3QP07 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
B020004C17RikJ3QP07 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
B020004C17RikJ3QP07 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
B020004C17RikJ3QP07 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
B020004C17RikJ3QP07 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
B020004C17RikJ3QP07 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
B020004C17RikJ3QP07 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
B020004C17RikJ3QP07 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
B020004C17RikJ3QP07 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
B020004C17RikJ3QP07 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
B020004C17RikJ3QP07 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
B020004C17RikJ3QP07 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
B020004C17RikJ3QP07 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms