Protein–RNA interactions for Protein: I3ITR1

AK157302, MCG50313, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AK157302I3ITR1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
AK157302I3ITR1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
AK157302I3ITR1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
AK157302I3ITR1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
AK157302I3ITR1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
AK157302I3ITR1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
AK157302I3ITR1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
AK157302I3ITR1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
AK157302I3ITR1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
AK157302I3ITR1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
AK157302I3ITR1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
AK157302I3ITR1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
AK157302I3ITR1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
AK157302I3ITR1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
AK157302I3ITR1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
AK157302I3ITR1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
AK157302I3ITR1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
AK157302I3ITR1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
AK157302I3ITR1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
AK157302I3ITR1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
AK157302I3ITR1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
AK157302I3ITR1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
AK157302I3ITR1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
AK157302I3ITR1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
AK157302I3ITR1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
AK157302I3ITR1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
AK157302I3ITR1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
AK157302I3ITR1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
AK157302I3ITR1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
AK157302I3ITR1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
AK157302I3ITR1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
AK157302I3ITR1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
AK157302I3ITR1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
AK157302I3ITR1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
AK157302I3ITR1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
AK157302I3ITR1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
AK157302I3ITR1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
AK157302I3ITR1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
AK157302I3ITR1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
AK157302I3ITR1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
AK157302I3ITR1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
AK157302I3ITR1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
AK157302I3ITR1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
AK157302I3ITR1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
AK157302I3ITR1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
AK157302I3ITR1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
AK157302I3ITR1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
AK157302I3ITR1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
AK157302I3ITR1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
AK157302I3ITR1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
AK157302I3ITR1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
AK157302I3ITR1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
AK157302I3ITR1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
AK157302I3ITR1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
AK157302I3ITR1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
AK157302I3ITR1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
AK157302I3ITR1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
AK157302I3ITR1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
AK157302I3ITR1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
AK157302I3ITR1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
AK157302I3ITR1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
AK157302I3ITR1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
AK157302I3ITR1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
AK157302I3ITR1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
AK157302I3ITR1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
AK157302I3ITR1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
AK157302I3ITR1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
AK157302I3ITR1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
AK157302I3ITR1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
AK157302I3ITR1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
AK157302I3ITR1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
AK157302I3ITR1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
AK157302I3ITR1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
AK157302I3ITR1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
AK157302I3ITR1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
AK157302I3ITR1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
AK157302I3ITR1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
AK157302I3ITR1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
AK157302I3ITR1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
AK157302I3ITR1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
AK157302I3ITR1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
AK157302I3ITR1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
AK157302I3ITR1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AK157302I3ITR1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
AK157302I3ITR1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AK157302I3ITR1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AK157302I3ITR1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AK157302I3ITR1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
AK157302I3ITR1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
AK157302I3ITR1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
AK157302I3ITR1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
AK157302I3ITR1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
AK157302I3ITR1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
AK157302I3ITR1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
AK157302I3ITR1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
AK157302I3ITR1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
AK157302I3ITR1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
AK157302I3ITR1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
AK157302I3ITR1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
AK157302I3ITR1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms