Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Y1

Trim55, MCG19772, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim55G3X8Y1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim55G3X8Y1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim55G3X8Y1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim55G3X8Y1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim55G3X8Y1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim55G3X8Y1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim55G3X8Y1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim55G3X8Y1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim55G3X8Y1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim55G3X8Y1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim55G3X8Y1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim55G3X8Y1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim55G3X8Y1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim55G3X8Y1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim55G3X8Y1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim55G3X8Y1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim55G3X8Y1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim55G3X8Y1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim55G3X8Y1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim55G3X8Y1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim55G3X8Y1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim55G3X8Y1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim55G3X8Y1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim55G3X8Y1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim55G3X8Y1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim55G3X8Y1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim55G3X8Y1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim55G3X8Y1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim55G3X8Y1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim55G3X8Y1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim55G3X8Y1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim55G3X8Y1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim55G3X8Y1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim55G3X8Y1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim55G3X8Y1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim55G3X8Y1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim55G3X8Y1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim55G3X8Y1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim55G3X8Y1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim55G3X8Y1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim55G3X8Y1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim55G3X8Y1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim55G3X8Y1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim55G3X8Y1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim55G3X8Y1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim55G3X8Y1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim55G3X8Y1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim55G3X8Y1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim55G3X8Y1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim55G3X8Y1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim55G3X8Y1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim55G3X8Y1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim55G3X8Y1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim55G3X8Y1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim55G3X8Y1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim55G3X8Y1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim55G3X8Y1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim55G3X8Y1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim55G3X8Y1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim55G3X8Y1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim55G3X8Y1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim55G3X8Y1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim55G3X8Y1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim55G3X8Y1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim55G3X8Y1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim55G3X8Y1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim55G3X8Y1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim55G3X8Y1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim55G3X8Y1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim55G3X8Y1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Trim55G3X8Y1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim55G3X8Y1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim55G3X8Y1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim55G3X8Y1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim55G3X8Y1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim55G3X8Y1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim55G3X8Y1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim55G3X8Y1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim55G3X8Y1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim55G3X8Y1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim55G3X8Y1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim55G3X8Y1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim55G3X8Y1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim55G3X8Y1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim55G3X8Y1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim55G3X8Y1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim55G3X8Y1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim55G3X8Y1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim55G3X8Y1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim55G3X8Y1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim55G3X8Y1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim55G3X8Y1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim55G3X8Y1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim55G3X8Y1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim55G3X8Y1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim55G3X8Y1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim55G3X8Y1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim55G3X8Y1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim55G3X8Y1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim55G3X8Y1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms