Protein–RNA interactions for Protein: G3UXE9

Gm8909, Predicted gene 8909, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8909G3UXE9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm8909G3UXE9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm8909G3UXE9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm8909G3UXE9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm8909G3UXE9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm8909G3UXE9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm8909G3UXE9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm8909G3UXE9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm8909G3UXE9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm8909G3UXE9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm8909G3UXE9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm8909G3UXE9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm8909G3UXE9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm8909G3UXE9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm8909G3UXE9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm8909G3UXE9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm8909G3UXE9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm8909G3UXE9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm8909G3UXE9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm8909G3UXE9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm8909G3UXE9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm8909G3UXE9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm8909G3UXE9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm8909G3UXE9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm8909G3UXE9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm8909G3UXE9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm8909G3UXE9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm8909G3UXE9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm8909G3UXE9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm8909G3UXE9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm8909G3UXE9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm8909G3UXE9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm8909G3UXE9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm8909G3UXE9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm8909G3UXE9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm8909G3UXE9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm8909G3UXE9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm8909G3UXE9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm8909G3UXE9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm8909G3UXE9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm8909G3UXE9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm8909G3UXE9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm8909G3UXE9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm8909G3UXE9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm8909G3UXE9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm8909G3UXE9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm8909G3UXE9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Gm8909G3UXE9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm8909G3UXE9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gm8909G3UXE9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gm8909G3UXE9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gm8909G3UXE9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm8909G3UXE9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm8909G3UXE9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm8909G3UXE9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm8909G3UXE9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm8909G3UXE9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm8909G3UXE9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm8909G3UXE9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm8909G3UXE9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm8909G3UXE9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm8909G3UXE9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm8909G3UXE9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm8909G3UXE9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm8909G3UXE9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm8909G3UXE9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm8909G3UXE9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm8909G3UXE9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm8909G3UXE9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm8909G3UXE9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm8909G3UXE9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm8909G3UXE9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm8909G3UXE9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm8909G3UXE9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm8909G3UXE9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm8909G3UXE9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm8909G3UXE9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm8909G3UXE9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm8909G3UXE9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm8909G3UXE9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm8909G3UXE9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm8909G3UXE9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm8909G3UXE9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm8909G3UXE9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm8909G3UXE9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm8909G3UXE9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm8909G3UXE9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm8909G3UXE9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm8909G3UXE9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm8909G3UXE9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm8909G3UXE9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm8909G3UXE9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm8909G3UXE9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm8909G3UXE9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm8909G3UXE9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm8909G3UXE9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm8909G3UXE9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm8909G3UXE9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm8909G3UXE9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm8909G3UXE9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms