Protein–RNA interactions for Protein: G3UXB3

Nkx1-1, NK1 homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-1G3UXB3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nkx1-1G3UXB3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nkx1-1G3UXB3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Nkx1-1G3UXB3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nkx1-1G3UXB3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nkx1-1G3UXB3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nkx1-1G3UXB3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nkx1-1G3UXB3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nkx1-1G3UXB3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nkx1-1G3UXB3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nkx1-1G3UXB3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Nkx1-1G3UXB3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nkx1-1G3UXB3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nkx1-1G3UXB3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nkx1-1G3UXB3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Nkx1-1G3UXB3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nkx1-1G3UXB3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nkx1-1G3UXB3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nkx1-1G3UXB3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nkx1-1G3UXB3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Nkx1-1G3UXB3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nkx1-1G3UXB3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Nkx1-1G3UXB3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nkx1-1G3UXB3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nkx1-1G3UXB3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nkx1-1G3UXB3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nkx1-1G3UXB3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nkx1-1G3UXB3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nkx1-1G3UXB3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nkx1-1G3UXB3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nkx1-1G3UXB3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nkx1-1G3UXB3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nkx1-1G3UXB3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Nkx1-1G3UXB3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Nkx1-1G3UXB3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nkx1-1G3UXB3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nkx1-1G3UXB3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nkx1-1G3UXB3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nkx1-1G3UXB3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nkx1-1G3UXB3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nkx1-1G3UXB3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nkx1-1G3UXB3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Nkx1-1G3UXB3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nkx1-1G3UXB3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nkx1-1G3UXB3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Nkx1-1G3UXB3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Nkx1-1G3UXB3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nkx1-1G3UXB3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nkx1-1G3UXB3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nkx1-1G3UXB3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nkx1-1G3UXB3 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Nkx1-1G3UXB3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nkx1-1G3UXB3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nkx1-1G3UXB3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Nkx1-1G3UXB3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nkx1-1G3UXB3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nkx1-1G3UXB3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nkx1-1G3UXB3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nkx1-1G3UXB3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Nkx1-1G3UXB3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nkx1-1G3UXB3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nkx1-1G3UXB3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nkx1-1G3UXB3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nkx1-1G3UXB3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nkx1-1G3UXB3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nkx1-1G3UXB3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nkx1-1G3UXB3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nkx1-1G3UXB3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nkx1-1G3UXB3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nkx1-1G3UXB3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nkx1-1G3UXB3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nkx1-1G3UXB3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nkx1-1G3UXB3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Nkx1-1G3UXB3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nkx1-1G3UXB3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nkx1-1G3UXB3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Nkx1-1G3UXB3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nkx1-1G3UXB3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nkx1-1G3UXB3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nkx1-1G3UXB3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nkx1-1G3UXB3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nkx1-1G3UXB3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nkx1-1G3UXB3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Nkx1-1G3UXB3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nkx1-1G3UXB3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nkx1-1G3UXB3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nkx1-1G3UXB3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nkx1-1G3UXB3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nkx1-1G3UXB3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nkx1-1G3UXB3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nkx1-1G3UXB3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nkx1-1G3UXB3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nkx1-1G3UXB3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nkx1-1G3UXB3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nkx1-1G3UXB3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Nkx1-1G3UXB3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nkx1-1G3UXB3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nkx1-1G3UXB3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nkx1-1G3UXB3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nkx1-1G3UXB3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms