Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM2

Ccl26, Chemokine (C-C motif) ligand 26, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl26F8VQM2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccl26F8VQM2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccl26F8VQM2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccl26F8VQM2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccl26F8VQM2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccl26F8VQM2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Ccl26F8VQM2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccl26F8VQM2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccl26F8VQM2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccl26F8VQM2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccl26F8VQM2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccl26F8VQM2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccl26F8VQM2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccl26F8VQM2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccl26F8VQM2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccl26F8VQM2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccl26F8VQM2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccl26F8VQM2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccl26F8VQM2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccl26F8VQM2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccl26F8VQM2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccl26F8VQM2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccl26F8VQM2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccl26F8VQM2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccl26F8VQM2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccl26F8VQM2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccl26F8VQM2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccl26F8VQM2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccl26F8VQM2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccl26F8VQM2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccl26F8VQM2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccl26F8VQM2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccl26F8VQM2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccl26F8VQM2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccl26F8VQM2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccl26F8VQM2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccl26F8VQM2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccl26F8VQM2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccl26F8VQM2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccl26F8VQM2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccl26F8VQM2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccl26F8VQM2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccl26F8VQM2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccl26F8VQM2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccl26F8VQM2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccl26F8VQM2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccl26F8VQM2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccl26F8VQM2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccl26F8VQM2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccl26F8VQM2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccl26F8VQM2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccl26F8VQM2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccl26F8VQM2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccl26F8VQM2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccl26F8VQM2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccl26F8VQM2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccl26F8VQM2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccl26F8VQM2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccl26F8VQM2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccl26F8VQM2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccl26F8VQM2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccl26F8VQM2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccl26F8VQM2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccl26F8VQM2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccl26F8VQM2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccl26F8VQM2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccl26F8VQM2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccl26F8VQM2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccl26F8VQM2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccl26F8VQM2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccl26F8VQM2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccl26F8VQM2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccl26F8VQM2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccl26F8VQM2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccl26F8VQM2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccl26F8VQM2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccl26F8VQM2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccl26F8VQM2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccl26F8VQM2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccl26F8VQM2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccl26F8VQM2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccl26F8VQM2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccl26F8VQM2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccl26F8VQM2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccl26F8VQM2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccl26F8VQM2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccl26F8VQM2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccl26F8VQM2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccl26F8VQM2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccl26F8VQM2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccl26F8VQM2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccl26F8VQM2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccl26F8VQM2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccl26F8VQM2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccl26F8VQM2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccl26F8VQM2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccl26F8VQM2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccl26F8VQM2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccl26F8VQM2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccl26F8VQM2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms