Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Farp1F8VPU2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Farp1F8VPU2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Farp1F8VPU2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Farp1F8VPU2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Farp1F8VPU2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Farp1F8VPU2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Farp1F8VPU2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Farp1F8VPU2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Farp1F8VPU2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Farp1F8VPU2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Farp1F8VPU2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Farp1F8VPU2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Farp1F8VPU2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Farp1F8VPU2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Farp1F8VPU2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Farp1F8VPU2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Farp1F8VPU2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Farp1F8VPU2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Farp1F8VPU2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Farp1F8VPU2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Farp1F8VPU2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Farp1F8VPU2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Farp1F8VPU2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Farp1F8VPU2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Farp1F8VPU2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Farp1F8VPU2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Farp1F8VPU2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Farp1F8VPU2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Farp1F8VPU2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Farp1F8VPU2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Farp1F8VPU2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Farp1F8VPU2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Farp1F8VPU2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Farp1F8VPU2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Farp1F8VPU2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Farp1F8VPU2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Farp1F8VPU2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Farp1F8VPU2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Farp1F8VPU2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Farp1F8VPU2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Farp1F8VPU2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Farp1F8VPU2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Farp1F8VPU2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Farp1F8VPU2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Farp1F8VPU2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Farp1F8VPU2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Farp1F8VPU2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Farp1F8VPU2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Farp1F8VPU2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Farp1F8VPU2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Farp1F8VPU2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Farp1F8VPU2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Farp1F8VPU2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Farp1F8VPU2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Farp1F8VPU2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Farp1F8VPU2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Farp1F8VPU2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Farp1F8VPU2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Farp1F8VPU2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Farp1F8VPU2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Farp1F8VPU2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Farp1F8VPU2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Farp1F8VPU2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Farp1F8VPU2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Farp1F8VPU2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Farp1F8VPU2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Farp1F8VPU2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Farp1F8VPU2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Farp1F8VPU2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Farp1F8VPU2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Farp1F8VPU2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Farp1F8VPU2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Farp1F8VPU2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Farp1F8VPU2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Farp1F8VPU2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Farp1F8VPU2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Farp1F8VPU2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Farp1F8VPU2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Farp1F8VPU2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Farp1F8VPU2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Farp1F8VPU2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Farp1F8VPU2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Farp1F8VPU2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Farp1F8VPU2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Farp1F8VPU2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Farp1F8VPU2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Farp1F8VPU2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Farp1F8VPU2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Farp1F8VPU2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Farp1F8VPU2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Farp1F8VPU2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Farp1F8VPU2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Farp1F8VPU2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Farp1F8VPU2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Farp1F8VPU2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Farp1F8VPU2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Farp1F8VPU2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Farp1F8VPU2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Farp1F8VPU2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms