Protein–RNA interactions for Protein: F7BCK0

Dcdc2b, Doublecortin domain-containing 2b (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dcdc2bF7BCK0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Dcdc2bF7BCK0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Dcdc2bF7BCK0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Dcdc2bF7BCK0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Dcdc2bF7BCK0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Dcdc2bF7BCK0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Dcdc2bF7BCK0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Dcdc2bF7BCK0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Dcdc2bF7BCK0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Dcdc2bF7BCK0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Dcdc2bF7BCK0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Dcdc2bF7BCK0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Dcdc2bF7BCK0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Dcdc2bF7BCK0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Dcdc2bF7BCK0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Dcdc2bF7BCK0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Dcdc2bF7BCK0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Dcdc2bF7BCK0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Dcdc2bF7BCK0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Dcdc2bF7BCK0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Dcdc2bF7BCK0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Dcdc2bF7BCK0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Dcdc2bF7BCK0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Dcdc2bF7BCK0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Dcdc2bF7BCK0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Dcdc2bF7BCK0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Dcdc2bF7BCK0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Dcdc2bF7BCK0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Dcdc2bF7BCK0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Dcdc2bF7BCK0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Dcdc2bF7BCK0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Dcdc2bF7BCK0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Dcdc2bF7BCK0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Dcdc2bF7BCK0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Dcdc2bF7BCK0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Dcdc2bF7BCK0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Dcdc2bF7BCK0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Dcdc2bF7BCK0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Dcdc2bF7BCK0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Dcdc2bF7BCK0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Dcdc2bF7BCK0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Dcdc2bF7BCK0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Dcdc2bF7BCK0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Dcdc2bF7BCK0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Dcdc2bF7BCK0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dcdc2bF7BCK0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dcdc2bF7BCK0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Dcdc2bF7BCK0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dcdc2bF7BCK0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dcdc2bF7BCK0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Dcdc2bF7BCK0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Dcdc2bF7BCK0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Dcdc2bF7BCK0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Dcdc2bF7BCK0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Dcdc2bF7BCK0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Dcdc2bF7BCK0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Dcdc2bF7BCK0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Dcdc2bF7BCK0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Dcdc2bF7BCK0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Dcdc2bF7BCK0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Dcdc2bF7BCK0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Dcdc2bF7BCK0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Dcdc2bF7BCK0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Dcdc2bF7BCK0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Dcdc2bF7BCK0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Dcdc2bF7BCK0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Dcdc2bF7BCK0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Dcdc2bF7BCK0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Dcdc2bF7BCK0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Dcdc2bF7BCK0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Dcdc2bF7BCK0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Dcdc2bF7BCK0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Dcdc2bF7BCK0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Dcdc2bF7BCK0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Dcdc2bF7BCK0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Dcdc2bF7BCK0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Dcdc2bF7BCK0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Dcdc2bF7BCK0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Dcdc2bF7BCK0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Dcdc2bF7BCK0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Dcdc2bF7BCK0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Dcdc2bF7BCK0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Dcdc2bF7BCK0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Dcdc2bF7BCK0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Dcdc2bF7BCK0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Dcdc2bF7BCK0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Dcdc2bF7BCK0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Dcdc2bF7BCK0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Dcdc2bF7BCK0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Dcdc2bF7BCK0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Dcdc2bF7BCK0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Dcdc2bF7BCK0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Dcdc2bF7BCK0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Dcdc2bF7BCK0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Dcdc2bF7BCK0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Dcdc2bF7BCK0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Dcdc2bF7BCK0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Dcdc2bF7BCK0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Dcdc2bF7BCK0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Dcdc2bF7BCK0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms