Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20538F6Z9R1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20538F6Z9R1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20538F6Z9R1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20538F6Z9R1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20538F6Z9R1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20538F6Z9R1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20538F6Z9R1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20538F6Z9R1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20538F6Z9R1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20538F6Z9R1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20538F6Z9R1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20538F6Z9R1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20538F6Z9R1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20538F6Z9R1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20538F6Z9R1 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20538F6Z9R1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20538F6Z9R1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20538F6Z9R1 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20538F6Z9R1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20538F6Z9R1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20538F6Z9R1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20538F6Z9R1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20538F6Z9R1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20538F6Z9R1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20538F6Z9R1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20538F6Z9R1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20538F6Z9R1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20538F6Z9R1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm20538F6Z9R1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm20538F6Z9R1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20538F6Z9R1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20538F6Z9R1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20538F6Z9R1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20538F6Z9R1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20538F6Z9R1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20538F6Z9R1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20538F6Z9R1 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20538F6Z9R1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20538F6Z9R1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20538F6Z9R1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20538F6Z9R1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20538F6Z9R1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20538F6Z9R1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20538F6Z9R1 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20538F6Z9R1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20538F6Z9R1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20538F6Z9R1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20538F6Z9R1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20538F6Z9R1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20538F6Z9R1 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20538F6Z9R1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20538F6Z9R1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20538F6Z9R1 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20538F6Z9R1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20538F6Z9R1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20538F6Z9R1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20538F6Z9R1 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20538F6Z9R1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20538F6Z9R1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20538F6Z9R1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20538F6Z9R1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20538F6Z9R1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20538F6Z9R1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20538F6Z9R1 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20538F6Z9R1 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20538F6Z9R1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20538F6Z9R1 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20538F6Z9R1 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20538F6Z9R1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20538F6Z9R1 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20538F6Z9R1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20538F6Z9R1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20538F6Z9R1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20538F6Z9R1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20538F6Z9R1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20538F6Z9R1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20538F6Z9R1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20538F6Z9R1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20538F6Z9R1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20538F6Z9R1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20538F6Z9R1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20538F6Z9R1 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20538F6Z9R1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20538F6Z9R1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20538F6Z9R1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20538F6Z9R1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20538F6Z9R1 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20538F6Z9R1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20538F6Z9R1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20538F6Z9R1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20538F6Z9R1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20538F6Z9R1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20538F6Z9R1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20538F6Z9R1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20538F6Z9R1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20538F6Z9R1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20538F6Z9R1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20538F6Z9R1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20538F6Z9R1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms