Protein–RNA interactions for Protein: F6Z6Z2

3110082J24Rik, RIKEN cDNA 3110082J24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3110082J24RikF6Z6Z2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
3110082J24RikF6Z6Z2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
3110082J24RikF6Z6Z2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
3110082J24RikF6Z6Z2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
3110082J24RikF6Z6Z2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
3110082J24RikF6Z6Z2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
3110082J24RikF6Z6Z2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
3110082J24RikF6Z6Z2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
3110082J24RikF6Z6Z2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
3110082J24RikF6Z6Z2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
3110082J24RikF6Z6Z2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
3110082J24RikF6Z6Z2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
3110082J24RikF6Z6Z2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
3110082J24RikF6Z6Z2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
3110082J24RikF6Z6Z2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
3110082J24RikF6Z6Z2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
3110082J24RikF6Z6Z2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
3110082J24RikF6Z6Z2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
3110082J24RikF6Z6Z2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
3110082J24RikF6Z6Z2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
3110082J24RikF6Z6Z2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
3110082J24RikF6Z6Z2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
3110082J24RikF6Z6Z2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
3110082J24RikF6Z6Z2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
3110082J24RikF6Z6Z2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
3110082J24RikF6Z6Z2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
3110082J24RikF6Z6Z2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
3110082J24RikF6Z6Z2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
3110082J24RikF6Z6Z2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
3110082J24RikF6Z6Z2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
3110082J24RikF6Z6Z2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
3110082J24RikF6Z6Z2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
3110082J24RikF6Z6Z2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
3110082J24RikF6Z6Z2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
3110082J24RikF6Z6Z2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
3110082J24RikF6Z6Z2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
3110082J24RikF6Z6Z2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
3110082J24RikF6Z6Z2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
3110082J24RikF6Z6Z2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
3110082J24RikF6Z6Z2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
3110082J24RikF6Z6Z2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
3110082J24RikF6Z6Z2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
3110082J24RikF6Z6Z2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
3110082J24RikF6Z6Z2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
3110082J24RikF6Z6Z2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
3110082J24RikF6Z6Z2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
3110082J24RikF6Z6Z2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
3110082J24RikF6Z6Z2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
3110082J24RikF6Z6Z2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
3110082J24RikF6Z6Z2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
3110082J24RikF6Z6Z2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
3110082J24RikF6Z6Z2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
3110082J24RikF6Z6Z2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.29■■□□□ 1
3110082J24RikF6Z6Z2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
3110082J24RikF6Z6Z2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
3110082J24RikF6Z6Z2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.28■■□□□ 1
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.28■■□□□ 1
3110082J24RikF6Z6Z2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.28■■□□□ 1
3110082J24RikF6Z6Z2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
3110082J24RikF6Z6Z2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.27■■□□□ 1
3110082J24RikF6Z6Z2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
3110082J24RikF6Z6Z2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
3110082J24RikF6Z6Z2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
3110082J24RikF6Z6Z2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
3110082J24RikF6Z6Z2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
3110082J24RikF6Z6Z2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
3110082J24RikF6Z6Z2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
3110082J24RikF6Z6Z2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
3110082J24RikF6Z6Z2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
3110082J24RikF6Z6Z2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
3110082J24RikF6Z6Z2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
3110082J24RikF6Z6Z2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
3110082J24RikF6Z6Z2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
3110082J24RikF6Z6Z2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
3110082J24RikF6Z6Z2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
3110082J24RikF6Z6Z2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
3110082J24RikF6Z6Z2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
3110082J24RikF6Z6Z2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
3110082J24RikF6Z6Z2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
3110082J24RikF6Z6Z2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
3110082J24RikF6Z6Z2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
3110082J24RikF6Z6Z2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
3110082J24RikF6Z6Z2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
3110082J24RikF6Z6Z2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
3110082J24RikF6Z6Z2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
3110082J24RikF6Z6Z2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms