Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm340F6RGI3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm340F6RGI3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm340F6RGI3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm340F6RGI3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm340F6RGI3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm340F6RGI3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm340F6RGI3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm340F6RGI3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm340F6RGI3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm340F6RGI3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm340F6RGI3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm340F6RGI3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm340F6RGI3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm340F6RGI3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm340F6RGI3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm340F6RGI3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm340F6RGI3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm340F6RGI3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm340F6RGI3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm340F6RGI3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm340F6RGI3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm340F6RGI3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm340F6RGI3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm340F6RGI3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm340F6RGI3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm340F6RGI3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm340F6RGI3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm340F6RGI3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm340F6RGI3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm340F6RGI3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm340F6RGI3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm340F6RGI3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm340F6RGI3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm340F6RGI3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm340F6RGI3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm340F6RGI3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm340F6RGI3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm340F6RGI3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm340F6RGI3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm340F6RGI3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm340F6RGI3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm340F6RGI3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm340F6RGI3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm340F6RGI3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm340F6RGI3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm340F6RGI3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm340F6RGI3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm340F6RGI3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm340F6RGI3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm340F6RGI3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm340F6RGI3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm340F6RGI3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm340F6RGI3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm340F6RGI3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm340F6RGI3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm340F6RGI3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm340F6RGI3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm340F6RGI3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm340F6RGI3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm340F6RGI3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm340F6RGI3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm340F6RGI3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm340F6RGI3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm340F6RGI3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm340F6RGI3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm340F6RGI3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm340F6RGI3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm340F6RGI3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm340F6RGI3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm340F6RGI3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm340F6RGI3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm340F6RGI3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm340F6RGI3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm340F6RGI3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm340F6RGI3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm340F6RGI3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm340F6RGI3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm340F6RGI3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm340F6RGI3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm340F6RGI3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm340F6RGI3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm340F6RGI3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm340F6RGI3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm340F6RGI3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm340F6RGI3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm340F6RGI3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm340F6RGI3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm340F6RGI3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm340F6RGI3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm340F6RGI3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm340F6RGI3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm340F6RGI3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm340F6RGI3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm340F6RGI3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm340F6RGI3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm340F6RGI3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm340F6RGI3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm340F6RGI3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm340F6RGI3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms