Protein–RNA interactions for Protein: F6QL70

Gm17669, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17669F6QL70 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm17669F6QL70 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm17669F6QL70 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm17669F6QL70 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm17669F6QL70 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm17669F6QL70 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm17669F6QL70 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm17669F6QL70 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm17669F6QL70 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm17669F6QL70 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm17669F6QL70 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm17669F6QL70 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm17669F6QL70 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm17669F6QL70 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm17669F6QL70 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm17669F6QL70 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm17669F6QL70 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm17669F6QL70 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm17669F6QL70 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm17669F6QL70 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm17669F6QL70 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm17669F6QL70 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm17669F6QL70 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm17669F6QL70 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm17669F6QL70 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm17669F6QL70 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm17669F6QL70 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm17669F6QL70 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm17669F6QL70 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm17669F6QL70 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm17669F6QL70 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm17669F6QL70 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm17669F6QL70 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm17669F6QL70 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm17669F6QL70 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm17669F6QL70 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm17669F6QL70 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm17669F6QL70 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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Gm17669F6QL70 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm17669F6QL70 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm17669F6QL70 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm17669F6QL70 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm17669F6QL70 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm17669F6QL70 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm17669F6QL70 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm17669F6QL70 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm17669F6QL70 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm17669F6QL70 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm17669F6QL70 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm17669F6QL70 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm17669F6QL70 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm17669F6QL70 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm17669F6QL70 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm17669F6QL70 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm17669F6QL70 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm17669F6QL70 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm17669F6QL70 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm17669F6QL70 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm17669F6QL70 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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Gm17669F6QL70 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm17669F6QL70 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm17669F6QL70 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm17669F6QL70 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm17669F6QL70 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm17669F6QL70 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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Gm17669F6QL70 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm17669F6QL70 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm17669F6QL70 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm17669F6QL70 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm17669F6QL70 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm17669F6QL70 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm17669F6QL70 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm17669F6QL70 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm17669F6QL70 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm17669F6QL70 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm17669F6QL70 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm17669F6QL70 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm17669F6QL70 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm17669F6QL70 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm17669F6QL70 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm17669F6QL70 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm17669F6QL70 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm17669F6QL70 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm17669F6QL70 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm17669F6QL70 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm17669F6QL70 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm17669F6QL70 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm17669F6QL70 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm17669F6QL70 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.6 ms