Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U0

Usp17lb, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein B, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lbE9Q9U0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp17lbE9Q9U0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp17lbE9Q9U0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp17lbE9Q9U0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp17lbE9Q9U0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp17lbE9Q9U0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp17lbE9Q9U0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp17lbE9Q9U0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp17lbE9Q9U0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp17lbE9Q9U0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp17lbE9Q9U0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp17lbE9Q9U0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp17lbE9Q9U0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp17lbE9Q9U0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp17lbE9Q9U0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp17lbE9Q9U0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp17lbE9Q9U0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp17lbE9Q9U0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp17lbE9Q9U0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp17lbE9Q9U0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp17lbE9Q9U0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp17lbE9Q9U0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp17lbE9Q9U0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp17lbE9Q9U0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp17lbE9Q9U0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp17lbE9Q9U0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp17lbE9Q9U0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp17lbE9Q9U0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp17lbE9Q9U0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp17lbE9Q9U0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp17lbE9Q9U0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp17lbE9Q9U0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp17lbE9Q9U0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp17lbE9Q9U0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp17lbE9Q9U0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp17lbE9Q9U0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp17lbE9Q9U0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp17lbE9Q9U0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp17lbE9Q9U0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp17lbE9Q9U0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp17lbE9Q9U0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp17lbE9Q9U0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp17lbE9Q9U0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp17lbE9Q9U0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp17lbE9Q9U0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp17lbE9Q9U0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp17lbE9Q9U0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp17lbE9Q9U0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp17lbE9Q9U0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp17lbE9Q9U0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp17lbE9Q9U0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp17lbE9Q9U0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp17lbE9Q9U0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp17lbE9Q9U0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp17lbE9Q9U0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp17lbE9Q9U0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp17lbE9Q9U0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp17lbE9Q9U0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp17lbE9Q9U0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp17lbE9Q9U0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp17lbE9Q9U0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp17lbE9Q9U0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp17lbE9Q9U0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp17lbE9Q9U0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp17lbE9Q9U0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp17lbE9Q9U0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp17lbE9Q9U0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp17lbE9Q9U0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp17lbE9Q9U0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp17lbE9Q9U0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp17lbE9Q9U0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp17lbE9Q9U0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp17lbE9Q9U0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp17lbE9Q9U0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Usp17lbE9Q9U0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp17lbE9Q9U0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp17lbE9Q9U0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp17lbE9Q9U0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp17lbE9Q9U0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp17lbE9Q9U0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp17lbE9Q9U0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp17lbE9Q9U0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp17lbE9Q9U0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp17lbE9Q9U0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp17lbE9Q9U0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp17lbE9Q9U0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp17lbE9Q9U0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp17lbE9Q9U0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp17lbE9Q9U0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp17lbE9Q9U0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp17lbE9Q9U0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp17lbE9Q9U0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp17lbE9Q9U0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp17lbE9Q9U0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp17lbE9Q9U0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp17lbE9Q9U0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp17lbE9Q9U0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp17lbE9Q9U0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp17lbE9Q9U0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp17lbE9Q9U0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
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