Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q2

R3hdm1, R3H domain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3hdm1E9Q9Q2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
R3hdm1E9Q9Q2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
R3hdm1E9Q9Q2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
R3hdm1E9Q9Q2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
R3hdm1E9Q9Q2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
R3hdm1E9Q9Q2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
R3hdm1E9Q9Q2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
R3hdm1E9Q9Q2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
R3hdm1E9Q9Q2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
R3hdm1E9Q9Q2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
R3hdm1E9Q9Q2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
R3hdm1E9Q9Q2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
R3hdm1E9Q9Q2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
R3hdm1E9Q9Q2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
R3hdm1E9Q9Q2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
R3hdm1E9Q9Q2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
R3hdm1E9Q9Q2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
R3hdm1E9Q9Q2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
R3hdm1E9Q9Q2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
R3hdm1E9Q9Q2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
R3hdm1E9Q9Q2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
R3hdm1E9Q9Q2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
R3hdm1E9Q9Q2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
R3hdm1E9Q9Q2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
R3hdm1E9Q9Q2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
R3hdm1E9Q9Q2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
R3hdm1E9Q9Q2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
R3hdm1E9Q9Q2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
R3hdm1E9Q9Q2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
R3hdm1E9Q9Q2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
R3hdm1E9Q9Q2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
R3hdm1E9Q9Q2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
R3hdm1E9Q9Q2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
R3hdm1E9Q9Q2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
R3hdm1E9Q9Q2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
R3hdm1E9Q9Q2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
R3hdm1E9Q9Q2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
R3hdm1E9Q9Q2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
R3hdm1E9Q9Q2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
R3hdm1E9Q9Q2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
R3hdm1E9Q9Q2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
R3hdm1E9Q9Q2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
R3hdm1E9Q9Q2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
R3hdm1E9Q9Q2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
R3hdm1E9Q9Q2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
R3hdm1E9Q9Q2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
R3hdm1E9Q9Q2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
R3hdm1E9Q9Q2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
R3hdm1E9Q9Q2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
R3hdm1E9Q9Q2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
R3hdm1E9Q9Q2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
R3hdm1E9Q9Q2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
R3hdm1E9Q9Q2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
R3hdm1E9Q9Q2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
R3hdm1E9Q9Q2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
R3hdm1E9Q9Q2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
R3hdm1E9Q9Q2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
R3hdm1E9Q9Q2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
R3hdm1E9Q9Q2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
R3hdm1E9Q9Q2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
R3hdm1E9Q9Q2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
R3hdm1E9Q9Q2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
R3hdm1E9Q9Q2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
R3hdm1E9Q9Q2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
R3hdm1E9Q9Q2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
R3hdm1E9Q9Q2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
R3hdm1E9Q9Q2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
R3hdm1E9Q9Q2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
R3hdm1E9Q9Q2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
R3hdm1E9Q9Q2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
R3hdm1E9Q9Q2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
R3hdm1E9Q9Q2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
R3hdm1E9Q9Q2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
R3hdm1E9Q9Q2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
R3hdm1E9Q9Q2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
R3hdm1E9Q9Q2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
R3hdm1E9Q9Q2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
R3hdm1E9Q9Q2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
R3hdm1E9Q9Q2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
R3hdm1E9Q9Q2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
R3hdm1E9Q9Q2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
R3hdm1E9Q9Q2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
R3hdm1E9Q9Q2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
R3hdm1E9Q9Q2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
R3hdm1E9Q9Q2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
R3hdm1E9Q9Q2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
R3hdm1E9Q9Q2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
R3hdm1E9Q9Q2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
R3hdm1E9Q9Q2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
R3hdm1E9Q9Q2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
R3hdm1E9Q9Q2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
R3hdm1E9Q9Q2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
R3hdm1E9Q9Q2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
R3hdm1E9Q9Q2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
R3hdm1E9Q9Q2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
R3hdm1E9Q9Q2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
R3hdm1E9Q9Q2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
R3hdm1E9Q9Q2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
R3hdm1E9Q9Q2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
R3hdm1E9Q9Q2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms