Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P1

Col22a1, Collagen, type XXII, alpha 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col22a1E9Q7P1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Col22a1E9Q7P1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Col22a1E9Q7P1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Col22a1E9Q7P1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Col22a1E9Q7P1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Col22a1E9Q7P1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Col22a1E9Q7P1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Col22a1E9Q7P1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Col22a1E9Q7P1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Col22a1E9Q7P1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Col22a1E9Q7P1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Col22a1E9Q7P1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Col22a1E9Q7P1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Col22a1E9Q7P1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Col22a1E9Q7P1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Col22a1E9Q7P1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Col22a1E9Q7P1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Col22a1E9Q7P1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Col22a1E9Q7P1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Col22a1E9Q7P1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Col22a1E9Q7P1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Col22a1E9Q7P1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Col22a1E9Q7P1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Col22a1E9Q7P1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Col22a1E9Q7P1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Col22a1E9Q7P1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Col22a1E9Q7P1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Col22a1E9Q7P1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Col22a1E9Q7P1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Col22a1E9Q7P1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Col22a1E9Q7P1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Col22a1E9Q7P1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Col22a1E9Q7P1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Col22a1E9Q7P1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Col22a1E9Q7P1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Col22a1E9Q7P1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Col22a1E9Q7P1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Col22a1E9Q7P1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Col22a1E9Q7P1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Col22a1E9Q7P1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Col22a1E9Q7P1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Col22a1E9Q7P1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Col22a1E9Q7P1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Col22a1E9Q7P1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Col22a1E9Q7P1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Col22a1E9Q7P1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Col22a1E9Q7P1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Col22a1E9Q7P1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Col22a1E9Q7P1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Col22a1E9Q7P1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Col22a1E9Q7P1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Col22a1E9Q7P1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Col22a1E9Q7P1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Col22a1E9Q7P1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Col22a1E9Q7P1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Col22a1E9Q7P1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Col22a1E9Q7P1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Col22a1E9Q7P1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Col22a1E9Q7P1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Col22a1E9Q7P1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Col22a1E9Q7P1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Col22a1E9Q7P1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Col22a1E9Q7P1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Col22a1E9Q7P1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Col22a1E9Q7P1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Col22a1E9Q7P1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Col22a1E9Q7P1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Col22a1E9Q7P1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Col22a1E9Q7P1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Col22a1E9Q7P1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Col22a1E9Q7P1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Col22a1E9Q7P1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Col22a1E9Q7P1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Col22a1E9Q7P1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Col22a1E9Q7P1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Col22a1E9Q7P1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Col22a1E9Q7P1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Col22a1E9Q7P1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Col22a1E9Q7P1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Col22a1E9Q7P1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Col22a1E9Q7P1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Col22a1E9Q7P1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Col22a1E9Q7P1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Col22a1E9Q7P1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Col22a1E9Q7P1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Col22a1E9Q7P1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Col22a1E9Q7P1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Col22a1E9Q7P1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Col22a1E9Q7P1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Col22a1E9Q7P1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Col22a1E9Q7P1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Col22a1E9Q7P1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Col22a1E9Q7P1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Col22a1E9Q7P1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Col22a1E9Q7P1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Col22a1E9Q7P1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Col22a1E9Q7P1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Col22a1E9Q7P1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Col22a1E9Q7P1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Col22a1E9Q7P1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms