Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E5

Srsf11, Serine/arginine-rich-splicing factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf11E9Q6E5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Srsf11E9Q6E5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Srsf11E9Q6E5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Srsf11E9Q6E5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Srsf11E9Q6E5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Srsf11E9Q6E5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Srsf11E9Q6E5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Srsf11E9Q6E5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Srsf11E9Q6E5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Srsf11E9Q6E5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Srsf11E9Q6E5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Srsf11E9Q6E5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Srsf11E9Q6E5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Srsf11E9Q6E5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Srsf11E9Q6E5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Srsf11E9Q6E5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Srsf11E9Q6E5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Srsf11E9Q6E5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Srsf11E9Q6E5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Srsf11E9Q6E5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Srsf11E9Q6E5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Srsf11E9Q6E5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Srsf11E9Q6E5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Srsf11E9Q6E5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Srsf11E9Q6E5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Srsf11E9Q6E5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Srsf11E9Q6E5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Srsf11E9Q6E5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Srsf11E9Q6E5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Srsf11E9Q6E5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Srsf11E9Q6E5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Srsf11E9Q6E5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Srsf11E9Q6E5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Srsf11E9Q6E5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Srsf11E9Q6E5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Srsf11E9Q6E5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Srsf11E9Q6E5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Srsf11E9Q6E5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Srsf11E9Q6E5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Srsf11E9Q6E5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Srsf11E9Q6E5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Srsf11E9Q6E5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Srsf11E9Q6E5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Srsf11E9Q6E5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Srsf11E9Q6E5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Srsf11E9Q6E5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Srsf11E9Q6E5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Srsf11E9Q6E5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Srsf11E9Q6E5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Srsf11E9Q6E5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Srsf11E9Q6E5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Srsf11E9Q6E5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Srsf11E9Q6E5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Srsf11E9Q6E5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Srsf11E9Q6E5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Srsf11E9Q6E5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Srsf11E9Q6E5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Srsf11E9Q6E5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Srsf11E9Q6E5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Srsf11E9Q6E5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Srsf11E9Q6E5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Srsf11E9Q6E5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Srsf11E9Q6E5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Srsf11E9Q6E5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Srsf11E9Q6E5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Srsf11E9Q6E5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Srsf11E9Q6E5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Srsf11E9Q6E5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Srsf11E9Q6E5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Srsf11E9Q6E5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Srsf11E9Q6E5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Srsf11E9Q6E5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Srsf11E9Q6E5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Srsf11E9Q6E5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Srsf11E9Q6E5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Srsf11E9Q6E5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Srsf11E9Q6E5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Srsf11E9Q6E5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Srsf11E9Q6E5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Srsf11E9Q6E5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Srsf11E9Q6E5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Srsf11E9Q6E5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Srsf11E9Q6E5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Srsf11E9Q6E5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Srsf11E9Q6E5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Srsf11E9Q6E5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Srsf11E9Q6E5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Srsf11E9Q6E5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Srsf11E9Q6E5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Srsf11E9Q6E5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Srsf11E9Q6E5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Srsf11E9Q6E5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Srsf11E9Q6E5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Srsf11E9Q6E5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Srsf11E9Q6E5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Srsf11E9Q6E5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Srsf11E9Q6E5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Srsf11E9Q6E5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Srsf11E9Q6E5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Srsf11E9Q6E5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms