Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5D8

Vmn2r48, Vomeronasal 2, receptor 48, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r48E9Q5D8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmn2r48E9Q5D8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn2r48E9Q5D8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn2r48E9Q5D8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn2r48E9Q5D8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn2r48E9Q5D8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn2r48E9Q5D8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn2r48E9Q5D8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn2r48E9Q5D8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn2r48E9Q5D8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn2r48E9Q5D8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn2r48E9Q5D8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn2r48E9Q5D8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn2r48E9Q5D8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn2r48E9Q5D8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn2r48E9Q5D8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn2r48E9Q5D8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vmn2r48E9Q5D8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vmn2r48E9Q5D8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vmn2r48E9Q5D8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vmn2r48E9Q5D8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vmn2r48E9Q5D8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vmn2r48E9Q5D8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vmn2r48E9Q5D8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vmn2r48E9Q5D8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vmn2r48E9Q5D8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vmn2r48E9Q5D8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vmn2r48E9Q5D8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmn2r48E9Q5D8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmn2r48E9Q5D8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmn2r48E9Q5D8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmn2r48E9Q5D8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmn2r48E9Q5D8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmn2r48E9Q5D8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn2r48E9Q5D8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn2r48E9Q5D8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn2r48E9Q5D8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn2r48E9Q5D8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn2r48E9Q5D8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn2r48E9Q5D8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn2r48E9Q5D8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn2r48E9Q5D8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn2r48E9Q5D8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn2r48E9Q5D8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn2r48E9Q5D8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn2r48E9Q5D8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn2r48E9Q5D8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn2r48E9Q5D8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn2r48E9Q5D8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn2r48E9Q5D8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vmn2r48E9Q5D8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vmn2r48E9Q5D8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vmn2r48E9Q5D8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vmn2r48E9Q5D8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vmn2r48E9Q5D8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vmn2r48E9Q5D8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vmn2r48E9Q5D8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmn2r48E9Q5D8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmn2r48E9Q5D8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmn2r48E9Q5D8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmn2r48E9Q5D8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmn2r48E9Q5D8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmn2r48E9Q5D8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmn2r48E9Q5D8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmn2r48E9Q5D8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmn2r48E9Q5D8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmn2r48E9Q5D8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmn2r48E9Q5D8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmn2r48E9Q5D8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmn2r48E9Q5D8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmn2r48E9Q5D8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmn2r48E9Q5D8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmn2r48E9Q5D8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmn2r48E9Q5D8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Vmn2r48E9Q5D8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmn2r48E9Q5D8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmn2r48E9Q5D8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmn2r48E9Q5D8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmn2r48E9Q5D8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmn2r48E9Q5D8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn2r48E9Q5D8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn2r48E9Q5D8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn2r48E9Q5D8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn2r48E9Q5D8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn2r48E9Q5D8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn2r48E9Q5D8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn2r48E9Q5D8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn2r48E9Q5D8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn2r48E9Q5D8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn2r48E9Q5D8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn2r48E9Q5D8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vmn2r48E9Q5D8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vmn2r48E9Q5D8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vmn2r48E9Q5D8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vmn2r48E9Q5D8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Vmn2r48E9Q5D8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vmn2r48E9Q5D8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vmn2r48E9Q5D8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Vmn2r48E9Q5D8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Vmn2r48E9Q5D8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms