Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
4930579F01RikE9Q3L6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
4930579F01RikE9Q3L6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
4930579F01RikE9Q3L6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4930579F01RikE9Q3L6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4930579F01RikE9Q3L6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4930579F01RikE9Q3L6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
4930579F01RikE9Q3L6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4930579F01RikE9Q3L6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
4930579F01RikE9Q3L6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
4930579F01RikE9Q3L6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4930579F01RikE9Q3L6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4930579F01RikE9Q3L6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
4930579F01RikE9Q3L6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4930579F01RikE9Q3L6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4930579F01RikE9Q3L6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4930579F01RikE9Q3L6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4930579F01RikE9Q3L6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4930579F01RikE9Q3L6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4930579F01RikE9Q3L6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4930579F01RikE9Q3L6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
4930579F01RikE9Q3L6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4930579F01RikE9Q3L6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4930579F01RikE9Q3L6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4930579F01RikE9Q3L6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4930579F01RikE9Q3L6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
4930579F01RikE9Q3L6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4930579F01RikE9Q3L6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4930579F01RikE9Q3L6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4930579F01RikE9Q3L6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
4930579F01RikE9Q3L6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
4930579F01RikE9Q3L6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
4930579F01RikE9Q3L6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4930579F01RikE9Q3L6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
4930579F01RikE9Q3L6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
4930579F01RikE9Q3L6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
4930579F01RikE9Q3L6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
4930579F01RikE9Q3L6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
4930579F01RikE9Q3L6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
4930579F01RikE9Q3L6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
4930579F01RikE9Q3L6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
4930579F01RikE9Q3L6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4930579F01RikE9Q3L6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4930579F01RikE9Q3L6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4930579F01RikE9Q3L6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4930579F01RikE9Q3L6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4930579F01RikE9Q3L6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4930579F01RikE9Q3L6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
4930579F01RikE9Q3L6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
4930579F01RikE9Q3L6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4930579F01RikE9Q3L6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4930579F01RikE9Q3L6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4930579F01RikE9Q3L6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4930579F01RikE9Q3L6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4930579F01RikE9Q3L6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4930579F01RikE9Q3L6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4930579F01RikE9Q3L6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4930579F01RikE9Q3L6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4930579F01RikE9Q3L6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4930579F01RikE9Q3L6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4930579F01RikE9Q3L6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
4930579F01RikE9Q3L6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
4930579F01RikE9Q3L6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
4930579F01RikE9Q3L6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4930579F01RikE9Q3L6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4930579F01RikE9Q3L6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4930579F01RikE9Q3L6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4930579F01RikE9Q3L6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4930579F01RikE9Q3L6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4930579F01RikE9Q3L6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
4930579F01RikE9Q3L6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4930579F01RikE9Q3L6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
4930579F01RikE9Q3L6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4930579F01RikE9Q3L6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
4930579F01RikE9Q3L6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4930579F01RikE9Q3L6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
4930579F01RikE9Q3L6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
4930579F01RikE9Q3L6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
4930579F01RikE9Q3L6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
4930579F01RikE9Q3L6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
4930579F01RikE9Q3L6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
4930579F01RikE9Q3L6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
4930579F01RikE9Q3L6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
4930579F01RikE9Q3L6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
4930579F01RikE9Q3L6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
4930579F01RikE9Q3L6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
4930579F01RikE9Q3L6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
4930579F01RikE9Q3L6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
4930579F01RikE9Q3L6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
4930579F01RikE9Q3L6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
4930579F01RikE9Q3L6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
4930579F01RikE9Q3L6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
4930579F01RikE9Q3L6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
4930579F01RikE9Q3L6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4930579F01RikE9Q3L6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4930579F01RikE9Q3L6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4930579F01RikE9Q3L6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
4930579F01RikE9Q3L6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4930579F01RikE9Q3L6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms