Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Fndc1E9Q043 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Fndc1E9Q043 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Fndc1E9Q043 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Fndc1E9Q043 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Fndc1E9Q043 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Fndc1E9Q043 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
Fndc1E9Q043 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Fndc1E9Q043 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Fndc1E9Q043 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Fndc1E9Q043 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Fndc1E9Q043 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Fndc1E9Q043 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Fndc1E9Q043 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Fndc1E9Q043 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Fndc1E9Q043 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Fndc1E9Q043 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Fndc1E9Q043 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Fndc1E9Q043 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Fndc1E9Q043 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
Fndc1E9Q043 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Fndc1E9Q043 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
Fndc1E9Q043 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Fndc1E9Q043 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Fndc1E9Q043 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Fndc1E9Q043 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Fndc1E9Q043 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Fndc1E9Q043 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Fndc1E9Q043 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Fndc1E9Q043 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
Fndc1E9Q043 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Fndc1E9Q043 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Fndc1E9Q043 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
Fndc1E9Q043 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Fndc1E9Q043 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Fndc1E9Q043 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Fndc1E9Q043 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Fndc1E9Q043 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Fndc1E9Q043 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Fndc1E9Q043 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Fndc1E9Q043 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Fndc1E9Q043 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Fndc1E9Q043 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Fndc1E9Q043 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Fndc1E9Q043 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
Fndc1E9Q043 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Fndc1E9Q043 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Fndc1E9Q043 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Fndc1E9Q043 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Fndc1E9Q043 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Fndc1E9Q043 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Fndc1E9Q043 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Fndc1E9Q043 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Fndc1E9Q043 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Fndc1E9Q043 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Fndc1E9Q043 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Fndc1E9Q043 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Fndc1E9Q043 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Fndc1E9Q043 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Fndc1E9Q043 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Fndc1E9Q043 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Fndc1E9Q043 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Fndc1E9Q043 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Fndc1E9Q043 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Fndc1E9Q043 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Fndc1E9Q043 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Fndc1E9Q043 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Fndc1E9Q043 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Fndc1E9Q043 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Fndc1E9Q043 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Fndc1E9Q043 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Fndc1E9Q043 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Fndc1E9Q043 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
Fndc1E9Q043 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
Fndc1E9Q043 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
Fndc1E9Q043 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Fndc1E9Q043 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Fndc1E9Q043 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Fndc1E9Q043 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Fndc1E9Q043 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Fndc1E9Q043 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Fndc1E9Q043 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Fndc1E9Q043 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Fndc1E9Q043 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Fndc1E9Q043 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
Fndc1E9Q043 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Fndc1E9Q043 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.72
Fndc1E9Q043 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Fndc1E9Q043 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Fndc1E9Q043 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Fndc1E9Q043 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Fndc1E9Q043 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Fndc1E9Q043 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Fndc1E9Q043 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Fndc1E9Q043 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Fndc1E9Q043 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Fndc1E9Q043 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Fndc1E9Q043 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Fndc1E9Q043 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
Fndc1E9Q043 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms