Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Scaf11E9PZM7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Scaf11E9PZM7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Scaf11E9PZM7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Scaf11E9PZM7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Scaf11E9PZM7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Scaf11E9PZM7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Scaf11E9PZM7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Scaf11E9PZM7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Scaf11E9PZM7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Scaf11E9PZM7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Scaf11E9PZM7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Scaf11E9PZM7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Scaf11E9PZM7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Scaf11E9PZM7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Scaf11E9PZM7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Scaf11E9PZM7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Scaf11E9PZM7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Scaf11E9PZM7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Scaf11E9PZM7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Scaf11E9PZM7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Scaf11E9PZM7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Scaf11E9PZM7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Scaf11E9PZM7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Scaf11E9PZM7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Scaf11E9PZM7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Scaf11E9PZM7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
Scaf11E9PZM7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Scaf11E9PZM7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Scaf11E9PZM7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Scaf11E9PZM7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Scaf11E9PZM7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Scaf11E9PZM7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Scaf11E9PZM7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Scaf11E9PZM7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Scaf11E9PZM7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Scaf11E9PZM7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Scaf11E9PZM7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Scaf11E9PZM7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Scaf11E9PZM7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Scaf11E9PZM7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Scaf11E9PZM7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Scaf11E9PZM7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Scaf11E9PZM7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Scaf11E9PZM7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Scaf11E9PZM7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Scaf11E9PZM7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Scaf11E9PZM7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Scaf11E9PZM7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Scaf11E9PZM7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Scaf11E9PZM7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Scaf11E9PZM7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Scaf11E9PZM7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Scaf11E9PZM7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Scaf11E9PZM7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Scaf11E9PZM7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Scaf11E9PZM7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Scaf11E9PZM7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Scaf11E9PZM7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Scaf11E9PZM7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Scaf11E9PZM7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Scaf11E9PZM7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Scaf11E9PZM7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Scaf11E9PZM7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Scaf11E9PZM7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Scaf11E9PZM7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Scaf11E9PZM7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Scaf11E9PZM7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Scaf11E9PZM7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Scaf11E9PZM7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Scaf11E9PZM7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Scaf11E9PZM7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Scaf11E9PZM7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Scaf11E9PZM7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Scaf11E9PZM7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Scaf11E9PZM7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Scaf11E9PZM7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Scaf11E9PZM7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Scaf11E9PZM7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Scaf11E9PZM7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Scaf11E9PZM7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Scaf11E9PZM7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Scaf11E9PZM7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Scaf11E9PZM7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Scaf11E9PZM7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Scaf11E9PZM7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Scaf11E9PZM7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Scaf11E9PZM7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Scaf11E9PZM7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Scaf11E9PZM7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Scaf11E9PZM7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Scaf11E9PZM7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Scaf11E9PZM7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Scaf11E9PZM7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Scaf11E9PZM7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Scaf11E9PZM7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Scaf11E9PZM7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Scaf11E9PZM7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Scaf11E9PZM7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Scaf11E9PZM7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms