Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ36

Pkhd1, Polycystic kidney and hepatic disease 1, mousemouse

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Length 4,059 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkhd1E9PZ36 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkhd1E9PZ36 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkhd1E9PZ36 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkhd1E9PZ36 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkhd1E9PZ36 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkhd1E9PZ36 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkhd1E9PZ36 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkhd1E9PZ36 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkhd1E9PZ36 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkhd1E9PZ36 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkhd1E9PZ36 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkhd1E9PZ36 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkhd1E9PZ36 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkhd1E9PZ36 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkhd1E9PZ36 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkhd1E9PZ36 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkhd1E9PZ36 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkhd1E9PZ36 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkhd1E9PZ36 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkhd1E9PZ36 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkhd1E9PZ36 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkhd1E9PZ36 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkhd1E9PZ36 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkhd1E9PZ36 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkhd1E9PZ36 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkhd1E9PZ36 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkhd1E9PZ36 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkhd1E9PZ36 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkhd1E9PZ36 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkhd1E9PZ36 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkhd1E9PZ36 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkhd1E9PZ36 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkhd1E9PZ36 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkhd1E9PZ36 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkhd1E9PZ36 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkhd1E9PZ36 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkhd1E9PZ36 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkhd1E9PZ36 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkhd1E9PZ36 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkhd1E9PZ36 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkhd1E9PZ36 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkhd1E9PZ36 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkhd1E9PZ36 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkhd1E9PZ36 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkhd1E9PZ36 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkhd1E9PZ36 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkhd1E9PZ36 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkhd1E9PZ36 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkhd1E9PZ36 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkhd1E9PZ36 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkhd1E9PZ36 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkhd1E9PZ36 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkhd1E9PZ36 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkhd1E9PZ36 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkhd1E9PZ36 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkhd1E9PZ36 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkhd1E9PZ36 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkhd1E9PZ36 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkhd1E9PZ36 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkhd1E9PZ36 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkhd1E9PZ36 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkhd1E9PZ36 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkhd1E9PZ36 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkhd1E9PZ36 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkhd1E9PZ36 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkhd1E9PZ36 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkhd1E9PZ36 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkhd1E9PZ36 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkhd1E9PZ36 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkhd1E9PZ36 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkhd1E9PZ36 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkhd1E9PZ36 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkhd1E9PZ36 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkhd1E9PZ36 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkhd1E9PZ36 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkhd1E9PZ36 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkhd1E9PZ36 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkhd1E9PZ36 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkhd1E9PZ36 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkhd1E9PZ36 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkhd1E9PZ36 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkhd1E9PZ36 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkhd1E9PZ36 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkhd1E9PZ36 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkhd1E9PZ36 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkhd1E9PZ36 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkhd1E9PZ36 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkhd1E9PZ36 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkhd1E9PZ36 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkhd1E9PZ36 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkhd1E9PZ36 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkhd1E9PZ36 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkhd1E9PZ36 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkhd1E9PZ36 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkhd1E9PZ36 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pkhd1E9PZ36 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pkhd1E9PZ36 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pkhd1E9PZ36 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pkhd1E9PZ36 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pkhd1E9PZ36 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms