Protein–RNA interactions for Protein: E9PV98

Trim5, Tripartite motif-containing 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim5E9PV98 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim5E9PV98 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim5E9PV98 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim5E9PV98 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim5E9PV98 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim5E9PV98 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim5E9PV98 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim5E9PV98 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim5E9PV98 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim5E9PV98 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim5E9PV98 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim5E9PV98 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim5E9PV98 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim5E9PV98 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim5E9PV98 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim5E9PV98 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim5E9PV98 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim5E9PV98 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim5E9PV98 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim5E9PV98 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim5E9PV98 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim5E9PV98 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim5E9PV98 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim5E9PV98 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim5E9PV98 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim5E9PV98 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim5E9PV98 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim5E9PV98 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim5E9PV98 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim5E9PV98 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim5E9PV98 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim5E9PV98 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim5E9PV98 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim5E9PV98 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim5E9PV98 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim5E9PV98 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim5E9PV98 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim5E9PV98 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim5E9PV98 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim5E9PV98 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim5E9PV98 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim5E9PV98 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trim5E9PV98 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trim5E9PV98 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim5E9PV98 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim5E9PV98 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim5E9PV98 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim5E9PV98 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim5E9PV98 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim5E9PV98 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim5E9PV98 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim5E9PV98 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim5E9PV98 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim5E9PV98 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim5E9PV98 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim5E9PV98 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim5E9PV98 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim5E9PV98 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim5E9PV98 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim5E9PV98 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim5E9PV98 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim5E9PV98 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim5E9PV98 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim5E9PV98 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim5E9PV98 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim5E9PV98 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim5E9PV98 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim5E9PV98 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim5E9PV98 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim5E9PV98 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim5E9PV98 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim5E9PV98 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim5E9PV98 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim5E9PV98 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim5E9PV98 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim5E9PV98 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim5E9PV98 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim5E9PV98 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim5E9PV98 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim5E9PV98 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim5E9PV98 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim5E9PV98 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim5E9PV98 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim5E9PV98 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim5E9PV98 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim5E9PV98 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim5E9PV98 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim5E9PV98 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim5E9PV98 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim5E9PV98 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim5E9PV98 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim5E9PV98 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim5E9PV98 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim5E9PV98 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim5E9PV98 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim5E9PV98 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim5E9PV98 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim5E9PV98 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim5E9PV98 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim5E9PV98 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms